文献类型: 中文期刊
作者: 曾维英 1 ; 苏燕竹 2 ; 赖振光 1 ; 杨守臻 1 ; 陈怀珠 1 ; 谭玉荣 1 ; 孙祖东 1 ; 盖钧镒 2 ;
作者机构: 1.广西农业科学院经济作物研究所/农业农村部西南玉米大豆间套作区农业科学观测实验站
2.南京农业大学大豆研究所/农业农村部大豆生物学与遗传育种重点实验室
关键词: 大豆;耐荫;BSA-Seq;候选基因
期刊名称: 中国油料作物学报
ISSN: 1007-9084
年卷期: 2021 年 006 期
页码: 1006-1015
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 间套种是我国南方大豆种植的重要模式,而高秆作物的遮荫胁迫导致大豆产量和品质难以提升,是制约大豆间套种发挥潜力的限制因素,因此对大豆耐荫性的解析尤为重要。本研究以强耐荫材料矮脚早和极不耐荫材料齐佩华为亲本构建RILs群体,根据耐荫指数表型鉴定RIL群体的耐荫性,从RIL群体中挑选出强耐荫和极不耐荫家系各30个,分别构建成两个极端性状DNA子代混合池,对子代混合池和亲本池分别开展平均60×和30×覆盖深度的全基因组重测序,通过计算两个子代池的SNP-index,比较SNP-index在耐荫池与不耐荫池染色体各区段的差异,定位耐荫性状的关联区域;根据基因注释信息,预测候选基因。结果表明4个样本共得到11 963 077个单核苷酸多态性(SNPs)标记,发现控制耐荫相关性状的基因主要集中在1号染色体51 942~505 708 bp区段、4号染色体50 972768~51 854 631 bp区段、9号染色体48 778 767~50 178 743 bp区段和18号染色体40 858 027~43 909 456 bp区段内,共包含408个基因,通过基因注释和功能分析发现ACC氧化酶5、生长素诱导蛋白5NG4、光敏色素相关丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶、转录因子MYBJ6和MYB128等5个基因可能在大豆耐荫过程中起着重要作用,确定为大豆耐荫性的候选基因。本研究结果将为解析大豆耐荫的分子机理奠定重要的基础,同时为大豆耐荫基因的图位克隆奠定坚实的理论基础。
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