科研产出
建兰'锦旗'叶片转录组分析
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要:建兰‘锦旗’(Cymbidium ensifolium’Jinqi’)为大金边叶艺传统品种,因其易花易植,观赏价值高而倍受人们喜爱。为了解建兰‘锦旗’叶艺中差异表达基因及分子调控途径,本研究对建兰‘锦旗’叶片绿叶部位和黄叶部位进行转录组测序和分析,共获得单基因簇(Unigenes) 32 393条,总长度为33 848 710 bp,平均长度为1 044.94 bp。通过与蛋白数据库的比对,18 063条Unigenes可获得注释信息。基因本体(gene ontology, GO)分析发现,共注释到49个功能组,其中代谢过程和细胞过程(生物学过程)、催化活性(分子功能)以及膜(细胞组分)的富集程度较高。KEGG分析结果表明差异表达基因主要参与光合作用等生物学过程的调节,共筛选出32条差异基因富集的代谢通路,58个差异表达转录因子。进一步筛选差异表达显著的20个转录因子,分析发现,其中上调表达15个,下调表达5个,主要经光合作用过程、黄酮类生物合成、卟啉和叶绿素代谢等机制介导建兰‘锦旗’叶色调控,提示其在建兰‘锦旗’叶艺进化中可能发挥重要的作用。本研究结果为探究建兰叶艺进化的分子机制研究提供参考。
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