科研产出
西番莲HSF基因家族的全基因组鉴定及成花期对高温胁迫的响应
《热带作物学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:热激转录因子(heat shock transcription factor, HSF)是重要的调节因子,在植物响应高温胁迫中发挥重要作用。高温胁迫对西番莲成花造成了严重的负面影响,因此研究HSF调控西番莲耐热性的意义重大。本研究利用生物信息学技术在西番莲基因组上鉴定了26个热激转录因子基因,分别命名为PeHSF1~PeHSF26。西番莲HSF基因编码蛋白长度为100~1589个氨基酸,分子量为11 544.9~177 157.8 g/mol,理论等电点为4.25~10.80。西番莲26个HSF基因分布在第1、4、5、6、7、8和9染色体上,分为10个亚群。西番莲全基因组复制事件分析结果表明,ZX01G0033270、ZX01G0052790和ZX01G0052980等5个HSF基因位于重复片段内。西番莲HSF基因有1~12个内含子和2~13个外显子,都包含HSF-DNA结合结构域。利用RNA-seq分析黄果原生种与金陵紫果HSF基因对高温环境的响应,发现ZX01G0002530、ZX01G0052790和ZX01G0121040等基因在花蕾中表达量差异显著,并通过RT-qPCR验证候选HSF基因表达水平。综合分析,推测西番莲响应高温胁迫的最理想的候选HSF基因为ZX01G0121040。这些结果有助于了解HSF在西番莲成花期响应高温胁迫过程中的功能,为西番莲耐高温的遗传改良提供重要基因资源和理论依据。
关键词: 西番莲 高温胁迫 热激转录因子 同源基因 成花 转录组测序 候选基因
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