科研产出
基于高密度遗传图谱定位广西普通野生稻导入系籽粒性状QTLs
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于高密度遗传图谱定位广西普通野生稻导入系籽粒性状QTLs,筛选关键候选基因,为水稻籽粒性状相关基因精细定位及育种改良提供理论参考.[方法]以广西普通野生稻 Y11为父本、籼型常规恢复系广恢 998(GH998)为母本,构建包含 281个株系的 BC3F9 导入系群体,对其进行籽粒性状分析及基因组测序,通过高密度遗传图谱定位粒长、粒宽、长宽比、千粒重相关QTLs,再通过基因功能注释、候选基因相对表达量检测筛选出关键候选基因.[结果]281个子代株系中,粒长的变异系数最小(3.41%),粒宽的变异系数最大(9.73%).粒长与千粒重呈显著正相关(P<0.05,下同),粒宽与千粒重呈显著正相关,与长宽比呈显著负相关.从281个子代株系中共检测到119 个籽粒相关性状QTLs,有22个为主效QTLs,其中粒长相关QTLs 10个、粒宽相关QTLs 5个、长宽比相关QTLs 3个、千粒重相关QTLs 4个,分布于水稻12条染色体,LOD为6.72~13.32,表型贡献率为10.75%~20.19%.筛选出5个多效性QTLs:2号染色体上的qGL2.2和qTGW2.1(26626185~34078363 bp)与粒长和千粒重相关;2号染色体上的qGW2.1和qGLWR2.1(10595289~18845781 bp)与粒宽和长宽比相关;3号染色体qGL3.1和qGLWR3.1(21022358~21038343 bp)及6号染色体上的qGL6.2和qTGW6.1(26793010~28240073 bp)与粒长相关;7号染色体上的qGW7.2和qTGW7.1(17771510~18372657 bp)与粒宽和千粒重相关.参考日本晴基因组同源序列的基因功能,从qGL6.1和qGW7.1区间共筛选出10个可能与籽粒性状相关的基因.qGL6.1区间的LOC_Os06g01670基因(MYB转录因子基因)作为影响水稻粒长的理想候选基因,该基因在短粒株系幼穗中高表达,推测其通过影响胚乳发育负调控粒长;qGW7.1区间的LOC_Os07g01740(半胱氨酸蛋白酶基因)和LOC_Os07g01940(染色单体粘连蛋白基因)在窄粒株系中高表达,推测其通过影响细胞分裂调控粒宽,将这2个基因列为影响水稻粒宽的候选基因.[结论]构建的广西普通野生稻导入系群体遗传效应较稳定,从中定位到22个籽粒性状主效QTLs,其中6号染色体上的qGL6.1和7号染色体上的qGW7.1是新的籽粒性状QTL,qGL6.1区间的LOC_Os06g01670基因与粒长相关,qGW7.1区间的LOC_Os07g01740和LOC_Os07g01940基因与粒宽相关,初步推测三者为影响籽粒性状的候选基因.
关键词： 野生稻 籽粒性状 导入系 高密度遗传图谱 QTLs定位
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小粒野生稻导入系子粒大小和形状的QTL定位
《湖北农业科学 》 2014 北大核心
摘要：通过AB-QTL分析法,应用Windows QTL Cartographer 2.5软件,于2009~2010年分别在武昌和南宁对一套小粒野生稻(Oryza minuta)导入系的子粒大小、粒长、粒宽与子粒长宽比进行QTL定位。2009年检测到18个QTLs,其中千粒重、粒长、粒宽和子粒长宽比分别检测到6、4、5和3个QTLs,单个QTL可解释表型贡献率的5.18%~21.33%;2010年检测到12个QTLs,其中千粒重、粒长、粒宽和子粒长宽比分别检测到6、2、2和2个QTLs,单个QTL可解释表型贡献率的6.68%~16.55%。两年均检测到的QTLs共有10个,其中4个新鉴定的QTLs的表型贡献率较大,分别为qTGW-9.2、qTGW-12、qGL-9和qGW-12,其增效基因均来自于小粒野生稻。这些携带有利QTL的小粒野生稻导入系是进行水稻(Oryza sativa)产量和品质改良的优良材料。
关键词： 小粒野生稻(Oryza minuta) 导入系 子粒大小 粒形 QTL定位
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小粒野生稻导入系对稻飞虱的抗性鉴定与分析
《植物遗传资源学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：稻飞虱是水稻生产最严重的害虫之一。野生稻拥有丰富的抗虫基因资源,导入系是鉴定和利用野生稻有利基因的有效途径。本研究通过对371份小粒野生稻导入系进行抗褐飞虱和白背飞虱接虫鉴定,分别筛选出了11份抗、72份中抗褐飞虱的材料和7份抗、45份中抗白背飞虱的材料,其中有5份材料兼抗褐飞虱和白背飞虱,这是从小粒野生稻中鉴定出抗白背飞虱材料的首次报道。通过对2份抗性导入系材料与感虫亲本杂交构建的F1和F2群体的抗虫鉴定和分析表明:K41对褐飞虱和白背飞虱的抗性受2对显性抗虫基因通过互补作用所控制;P114对褐飞虱和白背飞虱的抗性都是由1对主效的隐性基因控制。这些结果必将有利于小粒野生稻抗稻飞虱的基因定位和育种利用。
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影响水稻穗部性状及籽粒碾磨品质的QTL及其环境互作分析
《作物学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用优质恢复系测258为轮回亲本与粳型糯稻新品系IR75862杂交创制的BC1F7回交导入系群体,在广西南宁和海南三亚定位了产量相关性状(二次枝梗数、穗总粒数、穗实粒数、粒重和穗重)、粒型(粒长、宽、厚)和碾磨品质(糙米率、精米率和整精米率)的主效QTL并剖析其环境互作效应。双亲在穗实粒数、千粒重、粒长和粒宽及整精米率等性状上存在显著差异。各产量相关性状间呈极显著正相关,而与千粒重和粒长呈极显著负相关。多数产量及粒型相关性状与3种碾磨品质相关不显著。在南宁和三亚环境下检测到影响产量相关性状、粒型及碾磨品质的主效QTL共计57个,包括二次枝梗数6个,穗实粒数4个,穗总粒数、粒重和穗重各5个,粒长9个,粒宽7个,粒厚1个,糙米率4个,精米率5个和整精米率6个,分布在除第11染色体外的所有染色体上。多数影响枝梗数、穗粒数和粒重的QTL成簇分布,而且与影响糙米率、精米率和整精米率的QTL分布在不同染色体区域。在第2、第3、第4、第5和第6染色体上鉴定出影响穗粒数、粒重、粒型及碾磨品质的重要QTL,这些QTL在以往不同遗传背景和环境下被多次检测到。在第8染色体RM152～RM310区间鉴定到1个影响粒长和粒宽的新的QTL,能同步增加粒宽和粒长。鉴定出的这些稳定表达的QTL具有标记辅助选择育种的应用价值。整精米率是受环境影响最大的性状,其QTL的环境互作效应明显。对QTL的环境互作效应特点及其在品种标记辅助改良中的作用进行了深入探讨。
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