科研产出
果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶基因(RT)序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性,为深入研究果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列、转录转座活性及生物学功能提供理论参考.[方法]以果蔗品种拔地拉为试材,根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因保守区设计简并引物对,利用其进行PCR扩增,将目的条带回收纯化后连接至pMD18-T载体,并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序.依据测序结果对RT基因序列进行生物信息学分析.[结果]从果蔗拔地拉中扩增获得51条序列(SoRT4-1~SoRT4-51),去除重复序列和非RT基因序列后共获得44条RT基因序列,长度为423~433 bp,AT含量为56.84%~64.97%,AT:GC比值为1.32~1.85,核苷酸序列间相似性为44.4%~99.3%,其编码的氨基酸序列间相似性为10.8%~100.0%,说明氨基酸序列比核苷酸序列表现出更高异质性.44条RT基因序列被划分为4个家族,其中Ⅰ和Ⅲ为主要家族.44条RT基因编码的氨基酸序列中有20条发生了无义突变,说明其突变率较高.44条RT基因编码蛋白序列存在5种保守基序,其中,有29条序列同时包含Mo-tif 1~Motif 4,其余15条序列的保守基序变异较大,说明保守基序存在一定异质性.4个家族代表性序列编码蛋白的三级结构在氢键和转角的数量方面差异较大;系统发育进化树分析结果显示,44条RT基因序列被分为七大类,Ⅰ类和Ⅱ类中的果蔗RT基因序列分别占序列总数的40.91%和27.27%,Ⅱ类和Ⅵ类中的部分果蔗RT基因序列与拟南芥的BAB40828.1、粳稻的BAB40824.1、菠菜的BAB40833.1和大豆的BAB40834.1亲缘关系较近,推测这些物种在进化过程中发生了Ty3-gypsy类反转录转座子的横向传递.初步发现1条Ty3-gypsy类反转录转座子(SoRT4-40)具有转录活性.[结论]获得44条果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因序列,其中仅有1条序列具有转录活性,这些RT基因序列可用于开发基于Ty3-gypsy类反转录转座子的甘蔗分子标记.
关键词： 果蔗 Ty3-gypsy类反转录转座子 反转录酶 拔地拉 多样性
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低温下外源腐胺对黑皮果蔗拔地拉光合性能的影响
《西南农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：【目的】探讨外源腐胺对黑皮果蔗拔地拉(Saccharum officinarum L.cv.Badila)低温光合性能的影响,为果蔗低温育种和栽培措施的制定提供理论参考。【方法】采用低温培养箱处理的方法,对比分析外源腐胺叶面喷施结合低温处理和单独低温处理两种方式对拔地拉光合气体交换能力及叶绿素荧光效应与对照的差异。【结果】低温处理4 d后,和常温对照相比,除非光化学热耗散(NPQ)值外,其它光合气体交换参数值和叶绿素荧光参数值均显著下降,表明拔地拉是典型的冷敏感甘蔗类型。低温结合腐胺处理组和单独低温处理组相比,最大光化学效率Fv/Fm值、光响应曲线、Ci(胞间CO2浓度)响应曲线和CO2量子效率曲线值表现均升高,但NPQ响应曲线和电子传递量子效率曲线却表现相反,表明在低温下腐胺对拔地拉的效应主要与维持CO2同化相关,而对通过电子传递的能量耗散和非光化学途径的光能耗散没有明显作用。解除低温在常温下恢复4 d后,结合腐胺处理组除NPQ值之外,其余测定参数值都好于单独低温处理组,前者除了提供了更多光合产物外,极有可能还对光合机构结构的维持起重要作用。【结论】低温下外源腐胺处理对拔地拉光合碳同化的维持能力有明显效果,显著促进低温解除后光合性能的恢复,在果蔗生产中有潜在应用价值。
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长期冷适应对黑皮果蔗光合光能利用的影响
《生态学杂志 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：以拔地拉(Saccharum officinarum L.cv.Badila)幼苗为材料,研究了长期(28 d)冷适应处理(白天/夜间:12℃/8℃)对其光合光能利用的影响。结果表明:无论是常温(25℃)还是低温(12℃)测定,冷适应处理明显降低了蔗苗净光合速率(Pn),增加了暗呼吸速率(Rd)和电子传递量子效率和碳同化量子效率比值(ΦPSII/ΦCO2);常温下,冷适应处理降低了不同光强下Fv'/Fm'(和NPQ反向变化)随ΦPSII下降而下降的速率,同时增加了光化学淬灭q P随ΦPSII下降而下降的速率;而低温下,不同光强下Fv'/Fm'及q P随ΦPSII下降而下降的速率与对照没有显著差异;长期冷适应处理通过光化学途径和非光化学途径耗散了光合机构多余激发能,改善了其光合冷敏性,对果蔗抗冷栽培和抗低温育种有重要参考价值。
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果蔗拔地拉(Badila)健康种苗在黄山歙县的引种试验初报
《作物杂志 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：为了研究从广西农业科学院甘蔗研究所引进的黑皮果蔗拔地拉(Badila)健康种苗的种性表现,采用品种比较试验,于2012年在安徽黄山歙县富堨镇进行相关试验。结果表明:(1)在产量性状方面,健康果蔗株高167.9cm、茎长142.8cm、单茎重1.51kg、有效茎数4 103条/666.7m2,分别比对照高28.2cm、长20.8cm、重0.22kg、多71条,商品蔗理论产量6 195.5kg/666.7m2,比对照增产19.11%;(2)在品质方面,健康果蔗节间较长,比对照增长1.12cm,花皮蔗率比CK低7.71个百分点,田间锤度高1.86个百分点,口感脆甜;腊粉厚,蔗茎色泽好;此外,健康果蔗叶片茸毛较少,手感较光滑,叶片易脱落。初步认为拔地拉健康种苗适合在歙县当地的环境条件种植,商品性状优于当地栽培品种,深受蔗农欢迎,具有很好的发展前景。
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