科研产出
濒危植物秀丽兜兰叶绿体基因组特征与系统发育分析
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：秀丽兜兰(Paphiopedilum venustum)具有较高的观赏价值和保护生物学价值,野外资源濒临灭绝,叶绿体基因组(cpDNA)具有基因组小、结构稳定、高度的保守性等优点被广泛用于植物系统发育和物种鉴定,了解秀丽兜兰的叶绿体基因组结构,对揭示兜兰属植物的系统进化关系具有重要意义.本研究通过二代高通量测序技术获得秀丽兜兰叶绿体全基因组序列,利用 GeSeq、blast 和 hmmer 软件对叶绿体基因组进行注释,采用 MISA、CodonW、fasttree等生物信息学软件对其基因组结构、基因数目、序列重复、密码子偏好性和系统发育进行分析.结果表明:秀丽兜兰叶绿体基因组结构保守,具有典型的环状四分体结构,一对反向重复区(IRs)将大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)分开,全长 158 298 bp,GC含量为 35.4%,共注释得到 129 个基因,包括 79 个蛋白编码基因,38 个tRNA基因、8 个rRNA基因和 4 个假基因;检测到 78 个SSR位点,以单核苷酸重复和二核苷酸重复为主,分别占 84.62%和 10.26%,无五核苷酸重复,并且大多由A或T构成;确定了高频密码子 32 个,90.6%都以A或U结尾,编码亮氨酸(Leu)的密码子使用频率最高,而编码半胱氨酸(Cys)的密码子使用频率最低.通过比较 18 个兰科植物叶绿体基因组,构建系统进化树发现,紫花杓兰和西藏杓兰 2 个杓兰属植物被单独聚成一支,兜兰属被分成两大类,其中秀丽兜兰(P.venustum)与同属的紫纹兜兰(P.purpuratum)亲缘关系密切.本研究筛选出的 SSR 和核苷酸多态性能够作为兜兰属植物种质鉴定和遗传多样性的分子标记,可为珍稀濒危植物秀丽兜兰及其近缘种的种质鉴定、系统发育等提供理论依据,为兜兰属植物种群恢复、生物多样性保护、创新利用及新品种选育奠定基础.
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地方性农业科技期刊零被引论文特征及稿源优化───以《农业研究与应用》为例
《传播与版权 》 2023
摘要：为了分析非核心地方性农业科技期刊的零被引论文特征，文章以《农业研究与应用》 2011—2018年的零被引论文为研究对象，从下载量、作者单位数量、第一作者单位类型、作者数量、第一作者的学历和职称、论文类型、篇幅、基金项目和参考文献数量等方面分析零被引论文特征。结果发现，《农业研究与应用》2011—2018年载文量共计953篇，其中：零被引论文238篇，零被引率约为25%；零被引论文的篇均下载量约68次；零被引论文量随着论文作者单位数量、作者数量和参考文献数量的增加而减少；不同学历和职称的作者都有零被引论文，零被引论文量随着学历降低而减少，论文是否被引与第一作者的职称没有相关性；应用型论文与综述型论文的零被引论文量基本持平，但少于研究型论文；篇幅少于5页的论文零被引多；论文零被引与有无基金资助的相关性不大。针对这些零被引论文的特征，地方性农业科技期刊编辑部应进一步“做好选题策划工作，聚焦学术热点”“拓宽组稿渠道，加强培养和优化作者群”“加大审稿力度，严把稿件质量关”。
关键词： 农业科技期刊 零被引 零被引论文 特征分析 稿源优化
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《南方农业学报》2011～2015年高被引论文特征分析
《南方农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】分析《南方农业学报》2011~2015年高被引论文特征,找出与同行期刊的差距,并提出进一步提升期刊影响力的发展措施,以期更好地服务三农,为传承我国的农业科研成果做出贡献。【方法】以《南方农业学报》2011~2015年刊载的论文为研究对象,在中国知网(CNKI)高级检索界面进行检索,导出被引频次≥15次的论文,然后用Excel 2007进行数据整理分析。统计数据截至2016年10月31日。【结果】从中国知网检索到被引频次≥15次的《南方农业学报》刊载论文共49篇,其中2011年刊载的论文27篇(55.1%)、2012年刊载的论文17篇(34.7%)、2013年刊载的论文5篇(10.2%)。49篇高被引论文合计涉及发文作者261人次,篇均作者5.33人次,论文作者合作程度较高,但第一作者群的学历/职称水平还有很大提升空间。稿源分布以广西区内来稿为主(30篇),占61.2%;学科发展极不平衡,与栏目责任编辑的选题组稿存在较大关系。49篇高被引论文的基金论文比为93.9%,其中国家级基金论文、省部级基金论文分别占高被引论文总数的22.5%和34.7%,地厅级及以下基金论文占36.7%,且以广西农业科学院(主办主管单位)内设科技发展基金项目最多,达11项。【建议】结合地域优势,打造特色栏目;加快数字转型,提高社会影响;紧跟学科发展,培育核心作者;借助OA平台,缩短出版时滞。
关键词： 《南方农业学报》 高被引论文 特征分析 被引频次 发展措施
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基于NDVI的广西近十年植被变化特征分析
《南方农业学报 》 2012 CSCD
摘要：【目的】掌握广西的归-化植被指数(NDVI)变化及分布规律,为广西的生态保护和建设提供科学依据。【方法】采用1999～2011年SPOT VEGETATION数据分析广西近十年的NDVI时空变化特征。【结果】1999～2011年NDVI月最小值主要出现在2、3月,其中2月6次,3月5次,另外1月和4月分别各有1次;NDVI月最大值主要出现在9月,13年中共有9次出现在9月,两次出现在10月,两次出现在11月;1999～2011年平均NDVI值与年份间呈正相关,相关系数为0.692;2011年广西全区有94.55%面积的年平均NDVI比1999年高,5.45%的面积比1999年低;1999～2011年平均NDVI最高的地级市是梧州,为0.503;平均NDVI最低的地级市是北海,为0.405。【结论】广西NDVI通常在2、3月出现最低值,在9月出现最高值;环绕广西周边地区的NDVI值相对较高,桂中地区的NDVI值相对较低;1999～2011年广西NDVI年际间有较明显的上升趋势。
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