科研产出
分光光度计法在甘蔗白条病致病菌菌液浓度测定上的应用
《中国糖料 》 2022
摘要:采用分光光度计法,建立快速准确测定白条黄单胞杆菌菌液浓度的方法.首先在4个波长下,以分光光度计测定的不同稀释浓度白条黄单胞杆菌菌悬液光密度值(OD值)为自变量x,以平板计数法获得的对应稀释浓度菌悬液细菌浓度为因变量y,分别建立二者间的标准曲线和线性回归方程;根据回归方程的决定系数(R2)最大化、均方根误差(RMSE)和相对均方根误差(NRMSE)最小化原则筛选出最适波长和最优线性回归方程,最终实现菌悬液浓度的快速估算.结果表明,在4个波长下,平板计数法测定的白条黄单胞杆菌菌液浓度(0.5×108~12.5×108 cfu/mL)与分光光度计测定的OD值(0.03~1.95)之间线性关系良好,其中在600 nm波长下建立的标准曲线线性回归方程y=11.263x+0.117为最优方程,决定系数R2为0.9967,绝对误差RMSE为0.26×108 cfu/mL,相对误差NRMSE为4.93%.通过进一步应用验证,该回归方程预测结果与平板计数结果无显著差异(P>0.05).研究结果可靠准确,可作为测定白条黄单胞杆菌菌液浓度的标准方法进行应用.
关键词: 甘蔗白条病 白条黄单胞杆菌 分光光度计法 平板计数法 线性相关
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广西甘蔗白条病病原菌的分离鉴定
《植物检疫 》 2019 北大核心
摘要:为明确引起我国甘蔗检疫性细菌病害甘蔗白条病的病原菌及其症状特点,从广西来宾和崇左甘蔗主产区采集疑似白条病病害样本,采用组织分离法进行病原菌的分离,利用形态学与基因序列分析相结合的方法鉴定病原菌,柯赫氏法则回接验证病原菌的致病性。结果表明,引起广西甘蔗白条病的病原菌为白条黄单胞杆菌(Xanthomonas albilineans),16S-23S rRNA基因转录间隔区(ITS)基因序列分析以及白条黄单胞杆菌特异基因分析结果显示分离到的白条病病原菌与法国、巴西以及新西兰等国家的白条病病原菌同源性达到99%~100%。人工接种条件下,该病原菌还可侵染玉米并发生类似病症。本研究成功分离鉴定我国广西甘蔗白条病病原菌,为今后的致病机理研究和白条病抗病育种等方面奠定基础。
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广西北海蔗区甘蔗白条病发生情况调查
《南方农业学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要:【目的】对广西北海蔗区疑似发生甘蔗白条病的样本进行PCR检测鉴定,明确甘蔗白条病在广西北海的发生情况,为甘蔗白条病的防控提供科学依据。【方法】2016年11月,在广西北海合浦县、银海区和铁山港区采集疑似甘蔗白条病样本372份,涉及19个甘蔗品种/系,采用甘蔗白条病病原白条黄单胞菌[Xanthomonas albilineans(Ashby)Dowson]特异引物XAF1和XAR1对采集样本的DNA进行PCR检测。对部分有阳性条带的PCR产物进行切胶回收,并送样测序,然后在NCBI上进行BLAST比对分析。【结果】所采集的372份样本中,有78份样本扩增出目的条带,阳性检出率为20.97%;19个甘蔗品种中,有13个品种检测出阳性条带,检出率为68.42%,其中白叶病检出率较高的是柳城07-95、桂糖46号、桂糖42号和柳城07-536,检出率分别为75.00%、68.75%、48.15%和33.33%。部分阳性条带经克隆后测序,在NCBI上进行BLAST比对分析,发现其与广西白条病分离物KY315212.1的同源性为99%,表明它们均属于甘蔗白条病基因片段序列。【结论】甘蔗白条病已在广西北海蔗区发生危害,今后需加强检疫工作,防止从疫区调运感病蔗种,以控制病害进一步扩散蔓延。
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