科研产出
百香果(Passiflora edulis)R2R3-MYB基因家族的结构和功能分析
《果树学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究R2R3-MYB转录因子在代谢、发育等多种生物学过程中发挥的调控作用.对百香果R2R3-MYB基因家族进行表达分析并探究其在花果发育过程中的调控机制,对深入研究R2R3-MYB转录因子在百香果中的生物学作用中具有重要意义.[方法]基于百香果全基因组数据,通过HMM搜索对R2R3-MYB家族成员进行筛选鉴定,并利用实时荧光定量PCR分析其在百香果花不同组织中的表达模式.[结果]从百香果基因组中鉴定出99个R2R3-MYB基因,根据系统进化分析将其分为36个亚组.99个R2R3-PeMYB基因随机分布在9条百香果染色体上.基序和基因结构分析表明,R2R3-PeMYB在同一亚组中具有相对保守的结构特征.共线性分析表明,片段复制事件促进了百香果R2R3-MYB家族的扩张.基于转录组数据和qRT-PCR分析,发现R2R3-PeMYB基因在百香果花的不同组织的不同发育阶段中表现出差异的表达模式,说明R2R3-PeMYB基因在花不同组织和果实的发育过程中发挥重要作用,尤其是PeMYB62和PeMYB63在百香果果皮转色期的高表达,说明其可能参与百香果花青素的合成.同时8个R2R3-PeMYB基因在非生物胁迫(冷、热、盐和渗透压)下也表现出不同的反应,说明R2R3-PeMYB基因还受到非生物胁迫的诱导.[结论]鉴定了99个R2R3-PeMYB基因家族成员,发现其在百香果花果发育和胁迫诱导方面发挥重要作用,为今后研究百香果R2R3-MYB基因在花果发育中的功能和进化提供了有价值的线索.
关键词： 百香果 R2R3-MYB转录因子 系统发育分析 花果发育
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