科研产出
冷胁迫下果蔗叶片转录组分析及茉莉酸信号传导基因挖掘
《作物杂志 》 2025 北大核心 CSCD
摘要:探讨冷胁迫(0℃)条件下果蔗基因表达谱的变化,为果蔗抗寒育种、引种及栽培提供理论依据。采用高通量测序平台对对照组(25℃)和冷胁迫处理组(0℃)条件下果蔗进行转录组测序。对测序数据进行分析,筛选响应冷胁迫的茉莉酸代谢途径关键基因,对鉴定出的重要基因进行表达量的qRT-PCR验证。结果表明,低温胁迫处理后,2组样品通过筛选共获得321个差异表达基因(DEGs),其中167个基因上调,154个基因下调。GO功能富集分析显示,DEGs显著富集于催化活性、结合、代谢过程、细胞过程和细胞器等条目。KEGG途径富集分析发现,角质和木栓质合成、光合作用、脂肪酸代谢、淀粉和蔗糖代谢以及植物激素信号转导等为果蔗响应冷胁迫的重要代谢通路。qRT-PCR分析表明,冷胁迫后果蔗茉莉酸代谢途径相关基因SoPYL1、SoOPCL1、SoAOC1、SoLOX3、SoAOS1和SoMYC2均上调表达,该结果与转录组测序变化趋势相似,同时进一步证实了RNA-seq数据的准确性。
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