科研产出
基于高密度遗传图谱定位广西普通野生稻导入系籽粒性状QTLs
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]基于高密度遗传图谱定位广西普通野生稻导入系籽粒性状QTLs,筛选关键候选基因,为水稻籽粒性状相关基因精细定位及育种改良提供理论参考.[方法]以广西普通野生稻 Y11为父本、籼型常规恢复系广恢 998(GH998)为母本,构建包含 281个株系的 BC3F9 导入系群体,对其进行籽粒性状分析及基因组测序,通过高密度遗传图谱定位粒长、粒宽、长宽比、千粒重相关QTLs,再通过基因功能注释、候选基因相对表达量检测筛选出关键候选基因.[结果]281个子代株系中,粒长的变异系数最小(3.41%),粒宽的变异系数最大(9.73%).粒长与千粒重呈显著正相关(P<0.05,下同),粒宽与千粒重呈显著正相关,与长宽比呈显著负相关.从281个子代株系中共检测到119 个籽粒相关性状QTLs,有22个为主效QTLs,其中粒长相关QTLs 10个、粒宽相关QTLs 5个、长宽比相关QTLs 3个、千粒重相关QTLs 4个,分布于水稻12条染色体,LOD为6.72~13.32,表型贡献率为10.75%~20.19%.筛选出5个多效性QTLs:2号染色体上的qGL2.2和qTGW2.1(26626185~34078363 bp)与粒长和千粒重相关;2号染色体上的qGW2.1和qGLWR2.1(10595289~18845781 bp)与粒宽和长宽比相关;3号染色体qGL3.1和qGLWR3.1(21022358~21038343 bp)及6号染色体上的qGL6.2和qTGW6.1(26793010~28240073 bp)与粒长相关;7号染色体上的qGW7.2和qTGW7.1(17771510~18372657 bp)与粒宽和千粒重相关.参考日本晴基因组同源序列的基因功能,从qGL6.1和qGW7.1区间共筛选出10个可能与籽粒性状相关的基因.qGL6.1区间的LOC_Os06g01670基因(MYB转录因子基因)作为影响水稻粒长的理想候选基因,该基因在短粒株系幼穗中高表达,推测其通过影响胚乳发育负调控粒长;qGW7.1区间的LOC_Os07g01740(半胱氨酸蛋白酶基因)和LOC_Os07g01940(染色单体粘连蛋白基因)在窄粒株系中高表达,推测其通过影响细胞分裂调控粒宽,将这2个基因列为影响水稻粒宽的候选基因.[结论]构建的广西普通野生稻导入系群体遗传效应较稳定,从中定位到22个籽粒性状主效QTLs,其中6号染色体上的qGL6.1和7号染色体上的qGW7.1是新的籽粒性状QTL,qGL6.1区间的LOC_Os06g01670基因与粒长相关,qGW7.1区间的LOC_Os07g01740和LOC_Os07g01940基因与粒宽相关,初步推测三者为影响籽粒性状的候选基因.
关键词： 野生稻 籽粒性状 导入系 高密度遗传图谱 QTLs定位
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广西野生稻种质资源的抢救性调查收集及其抗病性初步鉴定
《植物遗传资源学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：针对广西野生稻濒危状况越来越严重的问题，抢救性收集广西野生稻种质资源，发掘其抗病基因，对广西野生稻资源丰富的地区开展了调查和收集，并对收集的部分资源进行了白叶枯病和稻瘟病抗性鉴定。结果表明，广西野生稻原记载的44个分布点中，仅剩24个尚有野生稻分布，濒危状况十分严重，近10年来野生稻分布点消失比例高达45.5%，水源被破坏和杂草竞争是危害野生稻生存的主要威胁因素；按照野生稻取样原则，共抢救性收集到11个普通野生稻和药用野生稻群体共317份种质资源；利用国际强毒菌株PXO99对177份材料进行白叶枯抗性鉴定，采用离体戳伤叶片鉴定的方法进行不同病菌小种（Guy11、RB22、FJ-3-2、FJ-3-5、FJ-2-3）的稻瘟病抗性鉴定，筛选出白叶枯抗性资源27份，稻瘟病抗性资源105份，兼抗白叶枯和稻瘟病的种质资源5份。针对广西野生稻抗病资源丰富但消失严重的问题，建议加强收集和保护，并加大种质资源鉴定力度。
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广西野生稻稻瘟病抗性鉴定及抗源地理分布
《南方农业学报 》 2017 北大核心 CSCD
摘要：【目的】明确广西野生稻对稻瘟病的抗性,为水稻抗瘟育种和挖掘抗瘟基因提供抗源材料。【方法】采用人工接种鉴定方法分别在苗期和孕穗期对广西野生稻进行稻瘟病混合菌株(ZA1、ZB1、ZB15和ZC15)接种,调查不同野生稻材料对叶瘟和穗颈瘟的抗性级别,统计抗感材料,并依据抗病材料地理来源进行统计分析。【结果】从普通野生稻中鉴定出抗叶瘟材料188份、抗穗颈瘟材料9份,占比分别为11.85%和0.58%;从药用野生稻中鉴定出抗叶瘟材料73份、抗穗颈瘟材料5份,占比分别为36.68%和2.54%;从普通野生野和药用野生稻中分别鉴定出兼抗叶瘟和穗颈瘟的材料9和4份,占比分别为0.58%和2.03%。贵港和梧州等地是广西野生稻抗稻瘟病材料最多的地区。【结论】广西野生稻抗叶瘟资源较丰富,但抗穗颈瘟或兼抗叶瘟、穗颈瘟的资源较匮乏,需进一步挖掘抗穗颈瘟及兼抗叶瘟和穗颈瘟材料。
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广西普通野生稻白叶枯病广谱抗源的鉴定与评价
《南方农业学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：【目的】鉴定与评价1498份广西普通野生稻对白叶枯病的抗性,为培育广谱持久的白叶枯病抗性水稻品种提供材料。【方法】利用华南籼稻区优势菌株(Ⅳ型),对1498份广西普通野生稻进行抗性初筛鉴定;并根据初筛获得的部分抗性稳定材料进行多菌系重复鉴定;对广西普通野生稻的居群抗病性与遗传多样性进行相关分析。【结果】经抗性初筛,获得70份对白叶枯病抗性稳定的材料;利用7个广西优势菌株(广西Ⅰ~Ⅶ型菌株)对其中60份材料进行广谱抗性筛选鉴定,结果发现在60份材料中,对Ⅰ~Ⅶ菌株抗性表现中抗以上的材料分别为43、50、45、58、52、46和46份。两份材料(RB11和RB19)对7个供试菌株均表现为抗水平;3份材料(RB5、RB7和RB31)分别对Ⅶ、Ⅴ、Ⅴ型菌株表现高抗。相关性分析结果表明,广西普通野生稻抗性材料出现的频率与居群遗传多样性指数相关性不显著,但与居群地理纬度呈极显著负相关。【结论】鉴定获得一批广谱抗源和高抗野生稻材料,可作为今后水稻白叶枯病抗性育种的重要抗源亲本。
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广西野生稻抗白叶枯病多菌系鉴定
《广西农学报 》 2012
摘要：白叶枯病是水稻生产的三大病害之一,目前水稻主栽品种的抗性较低,急需高抗品种。广西近年来新收集了大量的野生稻种质资源,为早日鉴定出新抗源提供育种利用,本试验对1 820份野生稻种质资源进行初筛鉴定,对部分3级以上的材料进行多菌系重复鉴定,获得一批1级抗性的新种质资源。
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栽培稻及其近缘野生种间杂交揭示杂草稻的起源
《植物遗传资源学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：通过水稻种间、亚种间和品种间的杂交,在套袋隔离和自然授粉两种条件下,对其杂交亲本主要农艺性状类型及杂交后代群体中杂草稻发生频率、类型及主要特征以及杂草稻的发生趋势进行调查分析,直接验证和重演杂草稻起源的主要路径。杂草稻的主要特征为:颖壳褐色或金色,种皮红色,散穗、易落粒,中长芒或无芒。结果表明,如果以近缘野生种为亲本,在其F2群体中比较容易发生类似杂草稻的单株;杂交组合中杂草稻出现频率的大小依次为:杂草稻或野生稻/粳稻(44.16%)>杂草稻或野生稻/籼稻(27.84%)>籼稻/粳稻(3.30%)>籼稻/籼稻(1.41%)>粳稻/粳稻(0)。这一结果显示杂交亲本间遗传差异越大,在后代中出现杂草稻类型植株的频率就越高。套袋条件下,后代中杂草稻出现的频率为10.70%,而不套袋情况下为4.90%。
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利用野生稻选育测253、测258恢复系及测交组合分子标记检测
《江西农业学报 》 2010
摘要：以不同野生稻和栽培稻亲本及其杂交后代恢复系测253、测258和测交组合博优253、博优258为材料,利用水稻12条染色体上的120对引物和SSR标记检测野生稻、栽培稻亲本在杂交后代中的遗传表现。结果表明,在120对引物中,6对引物RM28、RM287、RM347、RM303、RM278、RM154的多态性效果较好;6对SSR引物的扩增产物显示,野生稻的DNA片段已被导入野栽型恢复系及其优良组合中,并且分布在不同染色体上,说明通过远缘杂交大规模导入野生稻细胞核基因,对拓宽恢复系遗传背景是一个有效的方法。
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野生稻种质资源安全保存技术
《中国农学通报 》 2010 北大核心
摘要：介绍了野生稻种质资源保存的主要方法与技术及特点。野生稻资源保存采用原位保存与异位保存2种方式。原位保存也称原生境保存,通过在原生地建立保护区(点)保护资源;异位保存是对野生稻资源采取异地保存的一种方式,包括种质圃保存和种质库保存2种方法。原位与异位相结合,种质库、种质圃与原生境保护区(点)相补充的保存技术体系大大提高了中国野生稻资源保存的安全性。
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广西野生稻自然资源濒危现状评估报告
《广西农业科学 》 2010
摘要：采用《IUCN物种红色名录濒危等级和标准(3.1版)》对广西原记录有野生稻分布的14个市59个县240个乡(镇)1100多个分布点进行实地调查和濒危现状评估。实地调查发现有58个县属濒危以上等级,表明广西野生稻自然资源濒危现状严重。指出广西野生稻自然资源濒危现状严重主要是由于原生地消失、原生地环境质量恶化、外来物种入侵、过度放牧与频繁刈割等原因造成。提出提高野生稻保护级别;加大宣传力度,提高对野生稻自然资源的保护意识;完善野生稻资源的保护法规;加强对生态环境的保护、建立完善的野生稻原生境保护体系等保护措施。
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