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关键词:预测(模糊匹配)
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α-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的定量预测

《广西科学院学报 》 2014

摘要:【目的】利用α-淀粉酶Amy7c及其突变体的氨基酸信息,预测该酶的催化常数(Kcat),并筛选出能预测α-淀粉酶Kcat最具效果的氨基酸属性。【方法】先以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶Amy7C及其突变体催化常数的拟合。再将α-淀粉酶Amy7C及其54个突变体的数据分为2组,用35个酶作为训练组进行拟合,20个酶作为验证组进行检验。最后,对8种不同层次及神经元个数的模型进行比较。【结果】110个氨基酸属性可实现20-1神经网络模型收敛,表明这些氨基酸属性可用于预测α-淀粉酶的催化常数,不同指标的预测效果不同。多模型的分析结果显示,不同模型对训练组R值的结果具有显著性差异,而对训练组P值、验证组R值和验证组P值结果无显著性差异。【结论】氨基酸分布概率等属性可以用于预测α-淀粉酶催化常数。四层神经网络模型是预测α-淀粉酶催化常数的相对理想的模型。

关键词: 氨基酸属性 α-淀粉酶 催化常数 预测

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α-淀粉酶Amy7C及其突变体最适pH值的定量预测

《广西科学 》 2014

摘要:【目的】pH值是影响酶催化效率的关键参数,通常需要通过实验方式才能确定生物酶的最适pH值,而该方式要消耗较多的人力、物力和时间。因此,有必要发展一种利用酶的简单结构信息即可预测其最适pH值的方法。【方法】以20-1前馈反向传播的神经网络为模型,完成535种氨基酸属性对α-淀粉酶pH值的拟合。同时,将α-淀粉酶Amy7C及其54个突变体的数据分为2组,用35个酶作为训练组进行拟合,20个酶作为验证组进行检验,并对不同层次及神经元个数的模型进行比较。【结果】109个氨基酸属性可实现20-1神经网络模型收敛,表明这些氨基酸属性可用于预测α-淀粉酶的最适pH值,但是不同氨基酸属性预测pH值的效果差别较大,只有部分指标预测pH值的效果较好。多模型的分析结果显示,不同模型对训练组R值的结果具有显著性差异,而对训练组P值、验证组R值和验证组P值结果无显著性差异。【结论】氨基酸分布概率等属性可用于预测α-淀粉酶的最适pH值。20-1神经网络模型是预测α-淀粉酶最适pH值相对理想的模型。

关键词: α-淀粉酶 最适pH值 预测 氨基酸属性

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氨基酸和蛋白质的组合特征与秀丽隐杆线虫蛋白质的结晶倾向的相关分析

《广西科学 》 2013

摘要:通过逻辑回归和神经网络模型,分别研究3种单个氨基酸和整个蛋白质的组合特征与秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)蛋白质的结晶倾向的相关性,并以535种单个氨基酸特征为基准,进行蛋白质结晶倾向的相关比较。结果显示,组合特征与秀丽隐杆线虫蛋白质的结晶倾向具有相关性,可用于预测蛋白质的结晶倾向。

关键词: 秀丽隐杆线虫 逻辑回归 神经网络 预测 蛋白质结晶

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贝塔-葡萄糖苷酶催化反应的最适pH值和最适温度的同时预测(英文)

《广西科学 》 2011

摘要:利用氨基酸特征同时预测贝塔-葡萄糖苷酶反应的最适pH值和最适温度。首先,用不同的氨基酸特征对贝塔-葡萄糖苷酶进行量化作为输入,以最适pH值和最适温度作为输出;然后用20-2前馈反向传播的神经网络进行训练;最后用子集验证、刀切验证和交叉验证三种方法进行验证。结果表明,在24个氨基酸特征中只有4个特征可以用于模型预测,其中氨基酸分布概率的预测结果优于其它指标,为基于氨基酸属性预测酶的功能参数提供了方法。

关键词: 氨基酸 贝塔-葡萄糖苷酶 最适pH值 最适温度 预测 工作条件

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贝塔一葡萄糖苷酶催化反应的最适pH值和最适温度的同时预测

《广西科学 》 2011

摘要:利用氨基酸特征同时预测贝塔一葡萄糖苷酶反应的最适pH值和最适温度.首先,用不同的氨基酸特征对贝塔一葡萄糖苷酶进行量化作为输入,以最适pH值和最适温度作为输出;然后用20-2前馈反向传播的神经网络进行训练;最后用子集验证、刀切验证和交叉验证三种方法进行验证.结果表明,在24个氨基酸特征中只有4个特征可以用于模型预测,其中氨基酸分布概率的预测结果优于其它指标,为基于氨基酸属性预测酶的功能参数提供了方法.

关键词: 氨基酸 贝塔一葡萄糖 苷酶最适pH值 最适温度 预测 工作条件

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广西木薯生产潜力预测

《亚热带农业研究 》 2008

摘要:采用数量化分析模型对广西木薯种植面积、单产和总产进行预测研究。以广西1985-2004年木薯种植面积、单位面积鲜薯产量和总产量为样本,建立了木薯单产、总产潜力GM(1,1)时序预测模型、木薯面积潜力自回归时序预测模型。经拟合及精度检验,拟合指数均在0.85以上,历史符合率达100%,木薯单产模型为一级精度,木薯面积、总产模型为二级精度。预测结果表明,2005和2006年广西木薯单位面积鲜薯产量分别为21.46 t.hm-2和22.45 t.hm-2,木薯鲜薯总产量分别为582.89万t和617.37万t,木薯种植面积分别为26.2万hm2和27.09万hm2。

关键词: 木薯 生产潜力 预测 G(1,1)模型 自回归模型

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AR模型在柑桔溃疡病测报中的应用

《植物病理学报 》 2006 北大核心 CSCD

摘要:柑桔溃疡病发生程度的预测是进行该病治理的重要依据。本研究用自回归方法对2004年3月12日~2005年4月13日期间调查的病情原始数据进行标准化、平稳化处理以及模型的参数估计和拟合检验,所得AR(14)模型可以精确预测溃疡病发生趋势。

关键词: 柑桔溃疡病 预测 自回归模型

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