苦瓜抗白粉病SRAP标记筛选的PCR体系优化与验证

尚小红; 周生茂; 车江旅; 黄如葵; 梁任繁; 文俊丽; 郭元元; 梁和; 《南方农业学报 》 2013 CSCD

摘要：【目的】优化苦瓜抗白粉病SRAP标记的PCR体系,为获得苦瓜抗白粉病的SRAP分子标记、加快苦瓜抗白粉病新品种的选育提供参考。【方法】采用正交设计L16(45),在已有SRAP-PCR扩增程序基础上,以苦瓜抗、感白粉病的父母本及其杂交后代基因组DNA为模板,用4对SRAP引物对模板DNA、dNTPs、Mg2+、引物、TaqDNA聚合酶等5个因素浓度进行优化组合和验证。【结果】提取的苦瓜基因组DNA纯度较好,无蛋白质、RNA等物质污染,其纯度和完整性较好。利用引物对ME9-EM11进行PCR扩增,16个不同因素组合处理在苦瓜父本MC18和母本MC1-2的基因组DNA间的扩增结果有明显差异,其中以处理3的SRAP-PCR体系(20.0μL:DNA5.0ng/μL、dNTP0.05mmol/L、Mg2+2.5mmol/L、引物0.6μmol/L、TaqDNA聚合酶0.088U/μL)获得较清晰、较多的扩增条带。用4对引物对验证优化的SRAP-PCR体系,其重复性好,不同苦瓜材料间无明显的多态性。【结论】优化的SRAP-PCR体系适用于苦瓜抗白粉病SRAP分子标记的筛选。

关键词： 苦瓜 SRAP-PCR 体系优化 筛选 验证