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资源类型: 中文期刊
关键词:mtDNA(模糊匹配)
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广西五个稻区二化螟种群对氯虫苯甲酰胺的抗性及其遗传多样性分析

《植物保护学报 》 2025 北大核心 CSCD

摘要:为明确广西壮族自治区(简称广西)桂东、桂西、桂南、桂北和桂中5个稻区二化螟种群对氯虫苯甲酰胺的抗性水平及其遗传多样性,采用稻苗浸渍法测定这5个稻区二化螟种群对氯虫苯甲酰胺的抗性水平,以线粒体DNA(mitochondria DNA,mtDNA)CO Ⅱ基因为分子标记,利用MEGA、DnaSP和Arlequin等软件对这5个稻区20个二化螟地理种群的遗传多样性、遗传分化、分子变异和种群动态进行分析。结果显示:2023年广西13个二化螟地理种群对氯虫苯甲酰胺均为高水平抗性,抗性倍数介于113.7~513.5之间;20个二化螟地理种群共检测到40种单倍型,36个变异位点,总群体的单倍型多样性为0.698,总群体间遗传分化指数和基因流分别为0.122和1.799;5个稻区二化螟地理种群的遗传变异主要来自群体内个体间;桂南、桂北和桂中3个稻区二化螟地理种群很可能经历了种群扩张事件;5个稻区二化螟地理种群的地理距离与遗传距离无显著相关性;40个单倍型散布在不同的二化螟地理种群中,无明显的地理分布格局。表明广西5个稻区二化螟地理种群的遗传多样性较高,遗传分化程度低,基因交流水平较频繁,推测二化螟在面对环境变化时有较高的适应性和生存能力,这可能是二化螟在广西迅速扩散并对氯虫苯甲酰胺产生高水平抗性的主要原因之一。

关键词: 二化螟 线粒体基因 地理种群 遗传分化 基因流

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潮汕地区柑桔黄龙病菌及虫媒柑桔木虱的发生与种群研究

《中国南方果树 》 2022 北大核心

摘要:2020年8—12月,在柑桔黄龙病(Citrus Huanglongbing)及柑桔木虱起源地之一的潮汕地区,选择3种防控水平(有针对虫媒管理、无针对虫媒管理和无管理)蕉柑果园,调查对比植株黄龙病发病率,柑桔木虱发生量、种群类型、带菌率和阳性样品带菌量,黄龙病菌16S rDNA和前噬菌体序列。结果表明,有针对虫媒管理的果园,植株发病率最低,病级为轻度,仅见柑桔木虱成虫,且数量最低、不带黄龙病菌;无针对虫媒管理的果园,植株发病率显著提高,病级为轻度、中度或重度,柑桔木虱卵和若虫的数量及总虫数均最多,带菌率和带菌量均较低;无管理果园,植株发病率最高,病级主要为重度,柑桔木虱成虫数量最多,带菌率和带菌量均最高。3种防控水平果园的发病植株叶片和带菌柑桔木虱样品均携带黄龙病菌亚洲种Type 2原噬菌体类型,柑桔木虱均属于单一种群。

关键词: 柑桔黄龙病 柑桔木虱 菌株 种群 线粒体基因组

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普通野生稻线粒体蛋白质编码基因密码子使用偏好性的分析

《植物科学学报 》 2019 北大核心 CSCD

摘要:以普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)线粒体基因组为对象,分析其蛋白质编码基因的密码子使用特征及与亚洲栽培稻(O. sativa L.)的差异,探讨其密码子偏性形成的影响因素和进化过程。结果显示:普通野生稻线粒体基因组编码序列第1、第2和第3位碱基的GC含量依次为49.18%、42.67%和40.86%;有效密码子数(Nc)分布于45.32~61.00之间,其密码子偏性较弱; Nc值仅与GC_3呈显著相关,密码子第3位的碱基组成对密码子偏性影响较大;第1向量轴上显示9.91%的差异,其与GC_(3s)、Nc、密码子偏好指数(CBI)和最优密码子使用频率(Fop)的相关性均达到显著水平;而GC_3和GC_(12)的相关性未达到显著水平。因此,普通野生稻线粒体基因组密码子的使用偏性主要受自然选择压力影响而形成。本研究确定了21个普通野生稻线粒体基因组的最优密码子,大多以A或T结尾,与叶绿体密码子具有趋同进化,但是与核基因组具有不同的偏好性。同义密码子相对使用度(RSCU)、PR2偏倚分析和中性绘图分析显示,普通野生稻线粒体基因功能和其密码子使用密切相关,且线粒体密码子使用在普通野生稻、粳稻(O. sativa L. subsp. japonica Kato)和籼稻(O. sativa L. subsp.indica Kato)内具有同质性。

关键词: 普通野生稻 线粒体基因组 密码子偏好性 最优密码子

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低温胁迫对甘蔗幼苗根系线粒体生理生化作用的影响

《南方农业学报 》 2015 北大核心 CSCD

摘要:【目的】探讨低温胁迫对甘蔗根系线粒体生理生化作用的影响,为甘蔗抗寒育种提供参考依据。【方法】采用水培系统培养甘蔗幼苗,并于人工气候室在4℃下进行低温处理,以25℃培养为对照。采集不同处理天数甘蔗根系样品分离提取线粒体,进行超微结构观察及生理生化分析。【结果】低温胁迫导致甘蔗根系线粒体结构模糊、膜破裂或消失,嵴断裂、减少,线粒体解体;抗寒性强的GT28受损伤程度低于抗寒性弱的ROC22;甘蔗根系线粒体超氧阴离子自由基()含量和抗氧化防护系统相关酶POD、CAT活性升高,且GT28的POD、CAT活性高于ROC22的对应值,而含量低于ROC22的对应值;与对照相比,低温胁迫后GT28的SOD活性明显升高,而ROC22的明显降低。【结论】甘蔗根系线粒体结构的损伤程度与品种抗寒性呈负相关,抗寒性较弱的ROC22比GT28更易发生膜脂过氧化,使线粒体性能发生早衰,加速细胞死亡。

关键词: 甘蔗 根系 低温胁迫 线粒体 生理生化特性

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基于线粒体基因片段核苷酸多态性的亚洲栽培稻起源进化研究

《植物遗传资源学报 》 2013 北大核心 CSCD

摘要:亚洲栽培稻的祖先是普通野生稻,已成为世界公认的观点,然而亚洲栽培稻的2个亚种:粳稻和籼稻是一次起源还是二次起源仍存在很大争议,其起源地是国内还是国外依然是国际学者间争论的焦点。本文通过对184份亚洲栽培稻和203份普通野生稻3段基因序列cox3、cox1、orf 224和2段基因间序列ssv-39/178、rps2-trnfM的多样性研究,验证了以下观点:1)粳稻起源于中国,籼稻起源于中国和国外;2)亚洲栽培稻的起源为二次起源,即普通野生稻存在偏籼和偏粳2种类型,亚洲栽培稻的2个亚种籼稻和粳稻在进化过程中分别由偏籼型的普通野生稻和偏粳型的普通野生稻进化而来。

关键词: 线粒体基因组 基因多样性 起源 籼粳分化

mtDNA COI和ND5基因用于鉴别常见嗜尸性蝇类

《中国法医学杂志 》 2012 北大核心 CSCD

摘要:目的对蝇类mtDNA 523bp COI和347bp ND5基因片段进行序列分析,评价其在以嗜尸性蝇类种属鉴定中应用的可行性。方法从广州(广东省)、湛江(广东省)、韶关(广东省)、沈丘(河南省)及蜂蛹寨(四川省)采集7种嗜尸性蝇类标本,进行形态学种属鉴定,取其腹部肌肉提取DNA,利用基因特异性引物对线粒体COI、ND5基因进行PCR扩增,产物经纯化后进行测序,MEGA 3.0软件对DNA序列进行碱基组成、进化分歧率和系统发育分析。结果进化分歧率ND5基因种内小于1.83%,种间大于2.62%;种间与种内进化分歧率范围间没有交叉;COI基因种间在0.48%~14.8%之间,种内在0.24%~8.3%之间,种内进化分歧范围与种间进化分歧范围存在交叉。结论 ND5基因片段可在种水平有效鉴别常见嗜尸性蝇类,也可鉴别近缘种。而单独运用COI基因不能有效进行种属鉴定。

关键词: 法医昆虫学 嗜尸性蝇类 种属鉴定 mtDNA ND5 COI

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植物CMS线粒体相关开放阅读框(ORFs)研究进展

《种子 》 2011 北大核心 CSCD

摘要:从DNA、RNA、蛋白质水平分别阐述了线粒体开放阅读框(ORFs)与胞质雄性不育(CMS)的关系,并对目前发掘与胞质雄性不育相关的线粒体基因的研究策略进行了探讨。

关键词: 胞质雄性不育 线粒体 开放阅读框

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铝胁迫对花生根尖线粒体膜生理特性的影响

《作物学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要:线粒体在植物生命活动中发挥重要作用,以花生为材料,研究了在铝胁迫条件下,花生根尖细胞线粒体膜生理变化。结果表明,通过根长试验、苏木精染色和根尖铝离子含量测定,筛选到耐铝品种鲁花11(LH11),铝敏感品种R1549。铝胁迫后,两个品种根尖线粒体MDA含量增加,R1549的MDA含量均高于LH11,在处理浓度是20μmolL-1和100μmolL?1时,两品种的MDA含量差异显著,但在400μmolL-1时,差异不显著;两品种根尖线粒体Ca2+-ATP酶活性和Ca2+含量呈下降趋势,且随铝溶液浓度增加而加快,R1549的线粒体Ca2+含量下降较LH11快;随处理铝溶液浓度增加,线粒体光密度持续下降,MPT不断增大,ΔΨm明显降低,线粒体中Cytc/a减少,R1549较LH11下降更明显。试验结果说明在较高铝浓度胁迫下,两品种线粒体透性转换孔开放,膜透性增加,跨线粒体膜Ca2+转运系统活性降低,使胞质Ca2+超载,细胞色素C释放到细胞质中,诱导根尖细胞发生程序性死亡,从而抑制根生长;在低铝浓度下,与铝敏感品种相比,耐铝品种吸收铝少,脂质过氧化水平低,线粒体膜Ca2+-ATPase活性、MPTP和ΔΨm调控能力强,不易发生细胞程序性死亡,从而表现出较强的耐铝能力。

关键词: 铝胁迫 花生 根尖 线粒体 透性生理

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