科研产出
基于rDNA序列分析的3种丛枝菌根真菌分子鉴定方法比较
《南方农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】比较基于rDNA序列分析的3种丛枝菌根（AM）真菌分子鉴定方法，为提高AM真菌在种水平分子鉴定的准确性提供参考。【方法】对从柑橘和甘蔗等广西地区主要作物的根际土壤中分离出的AM真菌菌株（编号为A6、B3和GY3-1）进行形态学鉴定，再通过巢式PCR分别扩增AM真菌的18SrDNA、28Sr DNA及含ITS1、5.8SrDNA和ITS2的序列（简写为ITS1+5.8S+ITS2），分别将其测序结果与GenBank数据库进行比对，并构建系统发育进化树，再结合形态学鉴定结果比较基于3个r DNA序列分析分子鉴定方法的准确性。【结果】菌株A6、B3和GY3-1的形态特征分别与幼套近明球囊霉（Claroideoglomus etunicatum）、黏质隔球囊霉（Septoglomus viscosum）和摩西斗管囊霉（Funneliformismosseae）一致。基于18SrDNA序列，将菌株A6鉴定为近明球囊霉属（Claroideoglomus），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F. moessae），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum）。基于28S rDNA序列，将菌株A6鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F. moessae）。基于ITS1+5.8S+ITS2序列，将菌株A6鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum），菌株B3鉴定为黏质隔球囊霉（S. viscosum），菌株GY3-1鉴定为摩西斗管囊霉（F.moessae）。而综合3种分子鉴定结果，菌株A6、B3和GY3-1分别鉴定为幼套近明球囊霉（C. etunicatum）、黏质隔球囊霉（S. viscosum）和摩西斗管囊霉（F. mosseae）。【结论】3种方式均可用于AM真菌的在种水平上的分子鉴定，以18S rDNA与28S rDNA为主的鉴定方法相对简单且快速，更适用于对AM真菌在属水平的鉴定；以ITS1+5.8S+ITS2为主的鉴定方法步骤较繁琐，但鉴定至种水平的准确性较高。3种方法的分析结果在一定程度上可互相补充，加强对AM真菌分子鉴定结果的准确性。
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一种新的六倍体细胞类型水生薏苡的细胞遗传学鉴定
《植物学报 》 2004 CSCD
摘要：通过醋酸洋红压片和荧光原位杂交技术(包括基因组原位杂交技术),确定在我国广西西南部地区广泛分布着的水生薏苡(COIX AQUATICA ROXB.)属于一种新的六倍体细胞类型.这种水生薏苡与已报道的几种水生薏苡细胞类型的染色体数目均不相同,它的染色体数目是2N=30,在减数分裂前期Ⅰ和中期Ⅰ的细胞中形成10个二价体和10个单价体.基因组原位杂交结果表明,这种水生薏苡的20条染色体与四倍体的薏苡(C.LACRYMA-JOBI,2N＝20)的基因组DNA是高度同源的.45S和5S RDNA分别杂交到这种水生薏苡的两条染色体上,其中各有一条染色体与薏苡中携带45S和5S RDNA杂交信号的染色体具有相同的形状和信号的分布状态.据此推测:四倍体的薏苡可能是这种新的水生薏苡细胞类型的一个亲本,它的另一个亲本可能是八倍体的水生薏苡(C.AQUATICA,2N＝40),因为这种八倍体的水生薏苡在核型、植株形态及生长环境等方面与新的六倍体细胞类型的水生薏苡相似.
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