科研产出
基于QTL-Seq的水稻抗细菌性条斑病QTL定位
《中国水稻科学 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】发掘水稻抗细菌性条斑病新基因，丰富抗病基因资源，为水稻抗细菌性条斑病基因克隆及分子育种提供依据。【方法】以抗病材料广西普通野生稻WP1和感病品种9311及其衍生的F8:9代RIL群体为研究材料，利用QTL-Seq初定位与细菌性条斑病抗性相关的区间，之后利用QTLIciMapping4.1进行复合区间作图以验证结果并精细定位。【结果】分别在第4、8、10染色体上鉴定了一个与细菌性条斑病抗性相关的位点，复合区间作图验证了第4染色体抗细菌性条斑病QTL位点qBLS4.1，表型贡献率和LOD值分别为10.65%和5.03，并进一步将qBLS4.1精细定位在521kb的范围内。抗感亲本序列比对分析发现，在41个基因的编码区共有252个非同义突变，可能与细菌性条斑病抗性相关。【结论】通过QTL-seq分析结合复合区间作图法可以更快速高效地对水稻QTL进行定位，鉴定了一个抗细菌性条斑病性QTL新位点qBLS4.1，为水稻抗细菌性条斑病新基因鉴定与克隆奠定基础。
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基于残余杂合系的水稻显性矮秆基因的定位及KASP标记开发
《分子植物育种 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：株高是和水稻高产、稳产密切相关的重要农艺性状,发掘可育种利用的矮秆基因有重要的应用价值.本研究利用育种残余杂合系,鉴定了一个显性矮秆基因sd9,该基因能将株高降低18 cm.近等基因系F2群体的遗传学分析显示矮秆植株与高秆植株的分离比为3∶1,表明sd9为显性矮秆基因.构建了极高单株和极矮单株两个极端表型DNA混合池.利用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)和40 k水稻SNP检测液相芯片相结合的方法进行了DNA混合池的基因型鉴定,将sd9基因定位于第9染色体14 976 197~14 993 586 bp区间.根据该区间的SNP开发了sd9连锁的KASP标记,验证了定位结果.分子标记的单因素方差分析显示:区间内的分子标记和株高极显著相关.单个标记QTL检测LOD值为57.50,解释表型效应66.50%.利用育种残余杂合系鉴定的sd9及其KASP标记的开发,可以为水稻株型的分子育种提供可直接利用的基因资源.
关键词： 水稻 显性矮秆基因 育种残余杂合系 定位 靶向测序基因型检测
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