科研产出
水稻亚种间、品种间杂交揭示杂草稻的起源和进化
《分子植物育种 》 2012 CSCD
摘要：杂草稻是在稻田或可耕地周边生长的类似杂草并兼有野生稻和栽培稻特性的稻属植株或群体。迄今对杂草稻的发生和进化尚有很多的争论和假说,本研究通过水稻亚种间和品种间的杂交试验以及亲本与杂交后代籼粳分化分子标记的遗传分析,对杂草稻起源和进化途径进行了探讨并提出了相应的防控策略。研究结果显示:亚种间和品种间特定亲本杂交组合(7个籼/粳,4个籼/籼)的后代中均可分离出类似杂草稻的植株,其频率为籼/粳>籼/籼;籼粳交或籼籼交F2-F4代群体中产生类似杂草稻植株的频率随世代增加呈现递增趋势(F2最低为1.26%,F4最高为15.35%),这与双亲的遗传背景有密切关系,即籼、粳亚种的遗传背景差距越大,其杂交组合后代中产生杂草稻的机率越高;籼/粳交组合安山稻/9311F3代分离群体中类似杂草稻的植株以籼型为主(占52.8%);韩国粳稻品种安山稻在籼粳组合中不论作母本或父本,杂交后代都易产生类似杂草稻单株,这可能与其籼粳组分遗传异质性较高有关;粳/粳组合后代中未鉴定出类似杂草稻的植株,预示粳稻品种间杂交可能不易产生杂草稻。本研究为杂草稻的防控和利用研究提供参考依据。
香蕉突脐蠕孢叶斑病菌Brn1基因的PCR扩增与序列分析(英文)
《南方农业学报 》 2011 CSCD
摘要：【目的】为从分子水平进一步鉴定引起香蕉叶斑病的突脐蠕孢霉,对突脐蠕孢的Brn1基因序列进行了分析。【方法】用引物Brn101(5'-GCCAACATCGCAAACATGG-3')andBrn102(5'-GCAAGCAGCACCGTCAATACCAAT-3')对3个分生孢子形态差异较大的香蕉突脐蠕孢叶斑病菌(CLER09、D087和JL05)的Brn1基因进行PCR扩增和系统发育分析。【结果】不同菌株间存在简单的碱基缺失和替换,供试菌株与Exserohilum rostratum在系统发育树上聚类在同一个分支,与Exserohilum属其他种明显分开,形成一个独立的演化群。遗传距离分析表明,供试菌株与E.rostratum亲缘关系相近,菌株间的遗传距离为0.000～0.018,而Exserohilum属种间的遗传距离为0.020～0.093。【结论】E.rostratum菌株间的遗传变异较大,但仍属种内变异;Brn1基因可作为支持具有明显形态变异菌株为E.rostratum成员的分子依据。
关键词： 嘴突脐蠕孢 系统发育 Brn1降解酶基因 序列分析
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用微分方程组的解析解拟合甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化过程(英文)
《广西科学 》 2010
摘要：用数学模型对甲型流感病毒聚合酶酸性蛋白家族的进化进行拟合:(1)用氨基酸对的可预测性量化1918年至2008年分离的2433个聚合酶酸性蛋白以表示其演变,(2)确定上升半寿期和下降半衰期是否相似作为拟合的前提条件,(3)用微分方程组的解析解拟合进化,(4)用所获得的拟合参数模拟2009年至2018年可能的进化过程。结果呈现了对聚合酶酸性蛋白家族及其不同亚型的良好拟合,这标志着蛋白质进化的研究已经从经验性的实验分析向动力学的数学建模迈进。
关键词： 氨基酸对的可预测性 进化 拟合 甲型流感病毒 聚合酶酸性蛋白 微分方程
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中国榕属榕亚属植物的系统发育初探
《广西植物 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：对分布于中国的榕亚属植物的15个种和2个变种(分别代表榕亚属的3个组)的nrDNA的ITS序列和系统发育关系进行分析。结果表明,榕亚属是非单系起源,其中榕组构成了一个独立的单系群,与无花果亚属有较近的亲缘关系,而与榕亚属其它组间并未表现出近缘关系。榕亚属的其它5个组构成一单系群并得到中度的支持率。来自中国的种类分别聚在相应的组内。但环纹榕组被分成2个单支,其中来自中国的大叶水榕(F.glaberrima)和环纹榕(F.annulata)构成一个分支,二者表现较近的亲缘关系。榕亚属的亚洲特有组印度榕组在ITS树中聚在环纹榕组的另一个分支中,但它与此组其它种的亲缘关系并不清楚。
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广西水稻上嗜水小核菌的鉴定及系统发育研究
《植物病理学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：从类似纹枯病的水稻病株上分离到一种在菌核形态上与纹枯病菌(Rhizoctonia solani)有明显差异的真菌,致病性测定结果表明该菌能侵染水稻、玉米和大豆。对该菌的显微形态、生物学特性以及核糖体DNA-ITS序列进行研究,结果表明该菌为嗜水小核菌(Sclerotium hydrophilum Sacc.)。病菌在30℃、pH为6~9条件下生长表现最佳,属硫胺素自养型菌;营养菌丝与立枯丝核菌相似,菌核球形或椭圆形,数量极多,其平均大小仅为386.4μm×420.7μm;该菌的核糖体DNA-ITS序列与GenBank中唯一一个嗜水小核菌(登录号为DQ875597)的同源性为99.5%,并且与大多数丝核菌(Rhizoctonia spp.)也有一定的同源性,病菌的28S rDNA-RFLP分析结果进一步说明了该菌在系统发育上与丝核菌类真菌具有较高的同源性。通过比较该菌和几种与水稻纹枯病相关丝核菌核糖体DNA-ITS序列的差异,设计了一对特异性引物PS-1和PS-2,能专一地从被该菌侵染的水稻感病组织中扩增出一段约550bp的DNA。
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小腹茧蜂亚科的雄外生殖器及族级单元系统发育的研究(膜翅目:茧蜂科)
《昆虫学报 》 2002 北大核心 CSCD
摘要：对分布在东洋区和古北区的小腹茧蜂亚科 (膜翅目 :茧蜂科 ) 2 1个属的 6 7个种及外群折脉茧蜂属 (膜翅目 :茧蜂科 )2个种的雄外生殖器的 5个性状进行了比较研究。在形态学研究的基础上 ,通过选用头部、胸部和腹部 (包括雌雄外生殖器的性状 )等 34个性状 ,运用支序分析的方法探讨了分布在东洋区和古北区的小腹茧蜂亚科 2 1个属以及它们所属的族间的系统发育关系 ,并对Mason (1981)的分类系统进行了重新评价。雄外生殖器和支序分析基本上证实并恢复了由Mason(1981)确定的 2个主要分支 ,即绒茧蜂族Apantelini+小腹茧蜂族Microgastrini和拱茧蜂族Fornicini +盘绒茧蜂族Cotesiini +侧沟茧蜂族Microplitini。绒茧蜂族Apantelini、拱茧蜂族Fornicini和侧沟茧蜂族Microplitini为单系群也被支持 ,但小腹茧蜂族Microgastrini和盘绒茧蜂族Cotesiini是否为单系群尚难于在树形图中体现 ,而且族内各属间的分支关系有变动。因此 ,尽管Mason的族级分类单元有一些欠缺 ,但仍是可信、实用的 ,不同意Walker等 (1990 )认为不应再使用Mason分族系统的观点。
关键词： 小腹茧蜂亚科 雄性外生殖器 族级单元 系统发育 支序分析
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花生属野生种的核型分析及其进化
《中国油料 》 1990
摘要：本文研究了花生属六个区组的九个种,结果表明:除A.correntina和A.rigonii两个种没有随体外,其它二倍体种都有1—2对随体。除了A.batizocoi和A.villosulicarpa没有明显小的染色体外,其它种都有一对明显小的染色体。花生区组中具有“A”染色体组的三个种和缘脉区组的一个种的染色体全部是中部着丝点染色体,其它种有1—3对亚中部着丝点染色体。A.glabrata的染色体数为40,其核型不及栽培种对称,有3对亚中部着丝点染色体,没有“B”染色体。A.batizocoi与花生区组中的其它二倍体的核型差异较大,遗传距离也大,说明其进化程度高。五个区组二倍体种的进化程度,从低到高的顺序是:花生区组(具“A”染色体组的二倍体种→A.batizocoi)→缘脉区组→三籽粒区组→直立区组→围脉区组。
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