文献类型： 中文期刊
作者： 何芳练 1 ; 邱祖杨 2 ; 董伟清 1 ; 刘莉莉 2 ;
作者机构： 1.广西农业科学院生物技术研究所
2.荔浦市农业农村局
关键词： 荸荠;淀粉合成酶;基因克隆;表达分析
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2021 年 19 卷 017 期
页码： 5654-5661
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了克隆荸荠AGPase大亚基基因(EdAGPL1)cDNA序列,分析其序列结构特征及其在荸荠不同组织和球茎发育过程的表达情况.以荸荠'桂林马蹄'为研究材料,通过RT-PCR技术克隆得到EdAGPL1基因并对其进行生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR技术分析其不同组织和球茎发育过程的表达情况.结果 表明,克隆获得EdA GPL1基因长度为1744 bp,其开放阅读框为1599 bp,编码532个氨基酸,蛋白质分子质量为58.84 kD,等电点为7.54,具有NTP transferase和PbH1结构域;二级结构组成比例为螺旋结构(Helix)占13.72%,链状结构(Strand)占25.19%,无规则卷曲(Loop)占61.09%;三级结构由17个α-螺旋、34个β-折叠和51个β-转角(卷曲)构成.同源性及系统进化分析表明,EdAGPL1与其他植物AGPL蛋白氨基酸序列的同源性为57.54%~61.64%,在进化上与其他植物亲缘关系较远.荧光定量PCR分析表明,EdAGPL1在不同组织的表达情况为球茎>叶状茎>匍匐茎>根;在球茎各发育阶段,EdAGPL1在初期表达量最高,随后降低保持较稳定水平.EdAGPL1基因表达具有时空、组织特异性,可能是调控淀粉合成代谢途径中的关键基因,对该基因的研究有助于后续阐明荸荠淀粉合成的调控机理,进而为高淀粉品种选育提供理论依据.
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