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适于SSR-PCR的农作物基因组总DNA高通量提取方法的建立(英文)

文献类型: 中文期刊

作者: 张妍 1 ; 陈忠良 2 ; 莫璋红 3 ; 范业赓 4 ;

作者机构: 1.广西师范大学生命科学学院

2.广西农业科学院农业资源与环境研究所

3.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室广西师范大学生命科学学院中国农业科学院甘蔗研究中心/广西农业科学院甘蔗研究所/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室

4.广西农业科学院农产品质量安全与检测技术研究所农业部甘蔗品质监督检验测试中心

关键词: 甘蔗;水稻;玉米;花生;大豆;DNA提取;SSR

期刊名称: 南方农业学报

ISSN: 2095-1191

年卷期: 2012 年 43 卷 11 期

页码: 7-11

收录情况: CSCD

摘要: 【目的】建立一种新的、通用、快速的农作物基因组总DNA提取方法,为应用分子标记技术研究遗传多样性及变异提供方便。【方法】分别从甘蔗、水稻、玉米、花生和大豆5种作物中提取基因组DNA,用琼脂糖凝胶电泳对所提取的DNA质量进行检测,然后每种作物分别选取两对SSR引物进行PCR扩增,用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测扩增结果。【结果】采用该提取方法,不同作物产生的纯DNA在100.0~160.0g/g,提取DNA的A260/A280比率在1.80~1.95。此外,电泳凝胶未出现可见的RNA污染,每个作物基因组DNA单一条带非常清晰,DNA结构完整,质量较高,适用于分子标记的研究。应用SSR分子标记进行PCR扩增,重复性、稳定性好,经琼脂糖凝胶电泳检测,条带清晰且分辨率较高。【结论】建立的DNA提取方法为直接将叶片剪碎后装入EP管中,加入提取缓冲液进行DNA提取,省去了用液氮研磨的过程。与传统的DNA分离方法相比,新建立的DNA提取方法具有高通量、简单、快速、经济效益高等优点。

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