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普通烟草NtODB基因的电子克隆、表达及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈涛 1 ; 彭欣怡 1 ; 覃剑峰 1 ; 覃旭 1 ; 吴密 1 ; 黄锦媛 1 ; 黄显雅 1 ; 危丹妮 1 ; 王丽萍 1 ; 金刚 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区农业科学院广西亚热带作物研究所

关键词: 普通烟草;NtODB基因;DNA修复;电子克隆

期刊名称: 生物工程学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 008 期

页码: 2836-2844

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: ODB基因在植物同源重组依赖性的DNA双键断裂修复过程中起重要作用,对植物诱变育种具有潜在的应用价值。克隆烟草NtODB基因并分析其表达特征为丰富ODB基因在同源重组DNA修复过程中的作用提供证据。为得到烟草NtODB基因序列,采用电子克隆技术获得该基因cDNA序列并克隆验证。进一步使用生物信息学方法分析该基因表达特征,对预测蛋白的理化性质、信号肽、高级结构等进行预测。生物信息学分析结果表明,NtODB基因开放阅读框包含579个碱基,蛋白含192个氨基酸残基,NtODB蛋白具有碱性和亲水性,主要定位于细胞质内;实时荧光定量PCR检测结果显示NtODB基因在不同组织中呈现组成型表达特征;亚细胞定位检测提示NtODB主要表达于细胞膜和叶绿体。NtODB基因的克隆与表达分析及其蛋白高级结构和理化性质的预测,可为进一步丰富ODB基因在同源重组依赖的DNA修复系统中的作用机制提供证据。

  • 相关文献

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[2]马铃薯衰老相关基因的电子克隆与生物信息学分析. 何新民,谭冠宁,李丽淑,王晖,何海旺,唐洲萍. 2014

[3]陆地棉MS5同源基因的电子克隆及序列分析. 唐向民,刘冬梅,陈鹏,韦丽君,周瑞阳. 2014

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