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基于SNP分子标记的广西玉米种质材料类群结构分析及核心种质构建

文献类型: 中文期刊

作者: 陈坤 1 ; 黄安霞 1 ; 周锦国 1 ; 卢生乔 1 ; 覃宏宇 1 ; 韦正乙 1 ; 弓雪 1 ; 刘亚利 1 ; 张述宽 2 ; 钟昌松 2 ;

作者机构: 1.广西农业科学院玉米研究所

2.广西农业科学院

关键词: 玉米种质;遗传多样性;类群划分;SNP分子标记;核心种质

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2025 年 38 卷 009 期

页码: 1813-1821

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]对广西玉米种质材料进行类群结构分析和核心种质构建,为广西玉米种质资源的高效利用、多样性保护及品种改良提供参考依据.[方法]利用SNP分子标记对523份具有重要育种价值的玉米种质材料进行遗传多样性分析,基于主成分判别分析(Discriminant analysis of principal components,DAPC)法、K-means聚类法和系谱关系分析材料的群体结构和遗传差异;采用模拟退火算法,在30.00%~10.00%取样范围内,以5.00%梯度取样比例逐级探索构建广西玉米核心种质.[结果]通过7888个SNP分子标记分析发现,523份玉米种质材料的基因多样性(Genetic diversity,GD)平均值为0.391,多态信息含量(Polymorphism in-formation content,PIC)平均值为0.309,遗传多样性总体上处于中度多态.基于DAPC法和K-means聚类法,可将523份玉米种质材料划分为4个类群,分别为Suwan群、墨黄群、Reid群和Non-Reid群,其遗传多态性排序为Suwan群<墨黄群

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