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甘蔗核苷二磷酸激酶(NDPK1)基因克隆及表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李杨瑞 1 ; 杨丽涛 1 ;

作者机构： 1.广西大学亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室

关键词： 甘蔗;核苷二磷酸激酶;克隆;生物信息学分析;表达

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2012 年 33 卷 12 期

页码： 2199-2205

收录情况： CSCD

摘要： 采用RT-PCR技术克隆了甘蔗核苷二磷酸激酶基因全长cDNA,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况。结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为686 bp,包括1个450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,GenBank登录号为JQ712580。甘蔗与高粱NDPK基因cDNA序列的同源性为96%,氨基酸序列同源性为98%;该基因推导的蛋白分子量大小为16.83 ku,等电点为6.58,疏水性分值在-2.089～2.033;蛋白二级结构中α-螺旋占44.3%,随机卷曲占24.83%,延伸链占20.13%,β-转角只占10.74%。实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,NDPK1基因表达均呈先升高后降低的趋势,30 h达最大;在处理后的18、30、40 h,PEG与PEG+Si处理的NDPK1基因的表达量有显著差异。

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