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花生茎全长cDNA文库的构建与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 邓烨 1 ; 张冲 1 ; 蔡铁城 1 ; 熊发前 2 ; 唐荣华 2 ; 周双彪 1 ; 庄伟建 1 ;

作者机构： 1.福建省作物分子与细胞生物学重点实验室

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词： 花生;SMART技术;全长cDNA文库;茎

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2014 年 28 卷 10 期

页码： 1765-1772

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为挖掘花生茎中重要的功能基因,了解花生茎生长发育的分子机理,以闽花6号为材料,利用SMART技术成功构建了花生茎不同生育时期混合的全长cDNA文库,并对文库的部分序列进行了测序及分析。结果表明,该文库原始库容为1.25×106cfu·mL-1,重组率达100%,插入片段大小为750~2 000 bp,平均插入片段大小为1 000bp,达到文库质量要求。随机挑选50个单克隆进行5'端测序,共获得50条有效序列。通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因29个,未知功能基因9个,新基因12个,其中47个(94%)基因为花生未报道的基因。因此,该文库的构建为克隆和研究花生茎部重要表达基因,从分子水平上揭示花生茎的生长发育规律提供了基础。

  • 相关文献

[1]花生叶全长cDNA文库的构建和部分表达序列标签分析. 蔡铁城,张冲,邓烨,熊发前,唐荣华,周双彪,庄伟建. 2014

[2]龙眼茎冻害组织自然修复的解剖学研究. 朱建华,林鉴剑,彭宏祥,黄江流. 2003

[3]暹罗苏铁茎的解剖学研究. 黄玉源,陈金湘,伍映辉,黄爱花. 2011

[4]甘蔗茎RNA提取方法的比较. 范业赓,赵晓艳,何龙飞,黄荣韶,杨丽涛,李杨瑞. 2007

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