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宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张保青 1 ; 宋修鹏 1 ; 陈虎 2 ; 杨丽涛 1 ; 李杨瑞 1 ; 陈保善 1 ;

作者机构： 1.广西大学/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室

2.广西林业科学院

关键词： 甘蔗;宿根矮化病;cDNA-SCoT;差异基因

期刊名称： 作物学报

ISSN： 0496-3490

年卷期： 2013 年 39 卷 06 期

页码： 1119-1126

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究。结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800bp之间。从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列。生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面。进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2bα亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程。

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