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基于ITS和trnL-F序列的具有优良性状蕉类资源的遗传结构分析

文献类型： 中文期刊

作者： 龙芳 1 ; 武鹏 1 ; 邹瑜 1 ; 何海旺 1 ; 莫天利 1 ; 黄相 1 ; 赵明 1 ;

作者机构： 1.广西壮族自治区农业科学院生物技术研究所

关键词： 遗传结构;蕉类;ITS序列;trnL-F序列

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 176-185

收录情况： 北大核心

摘要： 为了构建广西具有优良性状的蕉类遗传结构,本研究收集了广西7个不同地理来源的5大种类具有优良性状的蕉类资源,利用PCR技术将这些蕉类资源细胞核DNA的ITS序列及叶绿体DNA的trnL-F序列进行扩增和测序,并对测序所获得的序列进行STRUCTURE分类、PCoA排序、AMOVA分析、群体遗传分化(F_(ST)指数)及基于NJ树和UPGMA树的聚类分析,进一步研究蕉类资源遗传变异分布和遗传变异水平。STRUCTURE结果显示:当K=2时,Delta K出现了最高的峰值,即将个体分为2个类别最合适,大蕉中的多数和野蕉中的少数可归为第一类,所有粉蕉、鸡蕉、香蕉和大多数的野蕉归为第二类。PCoA排序图显示粉蕉虽然个体数量较多,但是遗传多样性较低,而大蕉和野蕉具有较高的多样性。AMOVA分析表明遗传变异主要存在于群体内的个体间,方差占总和的63.088%,品种间的遗传变异大于品种内群体间的遗传变异,方差分别占总和的27.676%和9.236%。遗传分化非常大(F_(ST)>0.25)且P<0.05的群体绝大多数在不同蕉类型之间。NJ树和UPGMA树同样显示不同蕉类型之间的群体遗传距离较远。以上结果表明野蕉存在的历史最久,积累了大量的遗传变异;在人工杂交育种时,不同蕉之间的交配可能产生更多的具有遗传多样性的后代;具有育种潜力性状的粉蕉分布在遗传关系非常近的一个群体内,今后的资源收集时应该更加注重对某个粉蕉群体的详尽调查以发现更多的可利用性状。研究结果有助于对广西具有优良性状的蕉类资源的蕴藏状况和遗传潜力进行评估,为进一步的育种学应用奠定基础。

  • 相关文献

[1]广西蕉类特色种质资源收集、保存及评价. 龙芳,何海旺,赵明,武鹏,林茜,王趣有,李贤高. 2017

[2]广西蕉类种质资源概况及其育种创新利用前景. 彭宏祥,秦献泉,曹辉庆. 2008

[3]广西特色蕉类种质资源遗传多样性ISSR分析. 何海旺,赵明,龙芳,武鹏,林贵美,林茜. 2016

[4]中国榕属榕亚属植物的系统发育初探. 赵南先,郝刚,陈贻竹. 2009

[5]东南亚国家引进水稻种质的遗传多样性和遗传结构分析. 吕荣华,唐茂艳,王强,陈雷,郭辉,梁天锋,高国庆. 2018

[6]SSR等位变异数对普通野生稻居群遗传结构分析的影响. 陈成斌,张万霞,时津霞,任军方. 2005

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