文献类型： 中文期刊

作者： 蔡铁城 ¹ ; 张冲 ¹ ; 刘菁 ² ; 阳太亿 ² ; 陈华 ¹ ; 蒋菁 ² ; 贺梁琼 ² ; 韩柱强 ² ; 唐荣华 ² ; 庄伟建 ¹ ; 刘俊仙 ³ ; 熊发前 ² ;

作者机构： 1.福建农林大学植物保护学院

2.广西农业科学院经济作物研究所

3.广西农业科学院甘蔗研究所

关键词： 花生;Ty3-gypsy类反转录转座子;反转录酶;异质性;四倍体野生种

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 021 期

页码： 6972-6981

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究从四倍体野生种花生中分离了Ty3-gypsy类反转录转座子的反转录酶（RT）基因序列，分析了其序列特点和差异，为研究其转录活性和功能奠定基础。根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的保守区设计简并引物，PCR扩增四倍体野生种花生（Arachis monticola）（PI468199）的DNA，目的条带经回收、克隆和测序后，进行生物信息学分析。结果显示，目的条带大小约为430 bp，共有29条AmRT2-X基因序列被分离出，这些序列长度变化范围为397～433 bp,AT所占比例范围为55.66%～65.97%，核苷酸序列间相似性在45.1%～97.2%之间，存在较高异质性；29条AmRT2-X基因序列被聚类划分为8个家族，家族A是包含序列最多的家族；翻译成氨基酸后，有10条AmRT2-X基因序列发生了无义突变；氨基酸序列间相似性在22.3%～98.6%之间，呈现高度异质性；绝大部分AmRT2-X基因序列的保守基序一致；系统进化树显示，所有RT基因序列被分为6类，其中，Ⅰ类包含20条AmRT2-X基因序列，Ⅱ类中的4条Am RT2-X基因序列与来自拟南芥、多花黑麦草、火龙果、牡丹、果梅、枣、山桑、白皮松等物种的序列之间亲缘关系较近；通过比对花生EST数据库，发现2条具有转录活性的四倍体野生种花生Ty3-gypsy类反转录转座子。本研究为Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列的分离及其功能的研究提供一定基础。