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山药PAL基因全长cDNA序列的克隆、表达与分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王玲平 1 ; 向珣 2 ; 韦本辉 3 ; 李杨瑞 4 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院蔬菜研究所

2.浙江大学蔬菜研究所

3.浙江大学蔬菜研究所广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所浙江省农业科学院蔬菜研究所广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所广西壮族自治区农业科学院省重点实验室

4.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

关键词： 大薯;苯丙氨酸解氨酶;全长cDNA;基因克隆;序列分析;时空表达

期刊名称： 核农学报

ISSN： 1000-8551

年卷期： 2008 年 22 卷 06 期

页码： 43-50+121

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了阐明苯丙氨酸解氨酶(PAL,EC4.3.1.5)基因在山药地下块茎酚类物质积累过程中的分子机理,本研究运用普通PCR、RACE和TAIL-PCR技术从大薯(Dioscorea alataL.)’Zixiao’地下块茎中克隆到同一个PAL基因的3个片段,即长度分别为1 145bp、1 151bp和424bp的中间片段、3’端和5’端的cDNA序列;将3段cDNA序列拼接后获得大小为2 376bp的PAL基因全长cDNA序列,该序列含有一个1986bp的最大开放阅读框(ORF),一个28bp的5’端非翻译区,一个362bp含25 nt的Poly(A+)尾的3’端非翻译区,最大ORF可推测编码一个包括PAL酶活性中心的特征序列(GTITASGDLVPLSYIA)在内的661个氨基酸的多肽,分子量为71.974kDa,等电点6.310;大薯地下块茎的PAL基因分别在核苷酸与氨基酸水平上和GenBank中所选已知其他物种的同源性为73%~77%和76%~82%,说明PAL基因在系统进化上相对保守;RT-PCR分析表明该基因仅在地下块茎中表达,而且表达丰度在收获前逐渐降低。

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