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花生叶全长cDNA文库的构建和部分表达序列标签分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蔡铁城 1 ; 张冲 1 ; 邓烨 1 ; 熊发前 2 ; 唐荣华 2 ; 周双彪 1 ; 庄伟建 1 ;

作者机构： 1.福建省作物分子与细胞生物学重点实验室

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词： 花生;SMART技术;全长c DNA文库;叶;表达序列标签

期刊名称： 福建农林大学学报(自然科学版)

ISSN： 1671-5470

年卷期： 2014 年 43 卷 06 期

页码： 596-601

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以‘闽花6号’品种为材料,利用SMART技术成功构建了花生叶不同生育时期混合的全长c DNA文库,并对文库的部分序列进行测序及分析.结果表明,该文库原始库容为2.25×106cfu·m L-1,重组率达100%,插入片段大小为750-2000bp,平均插入片段大小为1000 bp,达到文库质量要求.随机挑选50个单克隆进行5'端测序,共获得50条有效序列.通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因25个,未知功能基因14个,新基因11个,其中49个(98%)基因为花生未报道的基因.参与代谢过程和胁迫响应的基因表达量较高.

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