文献类型： 中文期刊

作者： 滕峥 ¹ ; 刘开雨 ¹ ; 桑洪玉 ¹ ; 卢双楠 ¹ ; 方位宽 ² ; 梁朝旭 ² ; 刘晓静 ² ; 何姗珊 ² ; 刘芳 ¹ ; 邱永福 ¹ ; 李鸣 ³ ; 李容柏 ¹ ;

作者机构： 1.广西大学农学院

2.广西农业科学院甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室

3.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

关键词： 甘蔗;MAP;基因克隆;SoMAPK4;生物信息学

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2012 年 43 卷 06 期

页码： 11-16

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】克隆甘蔗MAP激酶家族新基因的全长序列,为了解甘蔗抗逆胁迫机制提供依据。【方法】以新台糖22为材料,提取甘蔗幼叶总RNA并反转录为cDNA;利用已知物种MAP激酶基因核苷酸序列保守区设计引物,采用5'和3'端RACE技术克隆新基因全长,并进行生物信息学分析。【结果】克隆获得的甘蔗新基因与玉米ZmMAPK4同源性很高,达92.6%,将该基因命名为SoMAPK4(登录号JQ062930),基因全长1499bp,其中开放阅读框(ORF)为1128bp,5'非翻译区(UTR)为218bp,3'非翻译区(UTR)为213bp。生物信息学分析结果表明,SoMAPK4基因编码一个含376个氨基酸的蛋白质,分子量约43.5kDa,等电点为5.51,含有11个保守的蛋白激酶亚区和MAP激酶的磷酸化位点TEY基序。【结论】克隆获得甘蔗MAP激酶新基因SoMAPK4,该基因可能参与多种胁迫反应的信号传递,是研究甘蔗非生物胁迫和生物胁迫过程中信号传递的一个关键因素。