文献类型: 中文期刊
关键词: 木薯(Manihot esculenta);转录组测序;花芽分化;开花基因
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2020 年 007 期
页码: 2108-2117
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究以木薯花芽与叶芽为材料,通过Illumina HiSeqTM4000测序平台对其进行转录组测序,结果获得高质量序列45 010 506个、碱基数13.46 Gb,GC含量在43.5%以上、比对效率在78%以上.筛选得到3 782个差异表达基因(DEGs),其中上调2 409个、下调1 373个.DEGs涉及的主要功能有一般功能预测,翻译,复制、重组与修复,信号传导机制,次生产物合成、运输与代谢,翻译后修饰、蛋白质周转和分子伴侣,氨基酸运输与代谢,碳水化合物运输与代谢.DEGs显著富集的KEGG通路主要有植物激素信号传导、苯丙烷类生物合成、淀粉和蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、氨基酸的生物合成和碳代谢.获得植物开花相关基因47个,其中39个上调表达、8个下调表达.研究结果在一定程度上解析了木薯花芽分化的分子机制,并为后续的深入研究提供了基础数据.
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