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基于RNA-seq番石榴果实软化候选基因的挖掘及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 范競升 1 ; 马松琼 1 ; 宁琳 1 ; 何江 1 ; 陈念 2 ; 欧景莉 1 ; 陈豪军 1 ; 陈丹 3 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室

2.南宁市农业科学研究所

3.广西农业职业技术大学农业工程学院

关键词: 番石榴;果实质地;转录组;候选基因

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2025 年 26 卷 001 期

页码: 189-201

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 番石榴变种丰富,不同品种的果实质地差异较大。果实的软化程度决定了其食用口感、运输贮藏及货架期等商品价值。为探究影响番石榴果实质地软化的调控基因,本研究比较了酥脆品种粉红蜜与软肉品种西瓜2号果实在坚熟期与软熟期的转录组。结果表明,软熟期品种间差异表达基因数目最多,GO注释显示差异基因主要富集在结合活性和催化活性等分子功能中,KEGG代谢通路分析显示差异基因主要富集在光合作用、光合作用天线蛋白、半乳糖代谢和植物激素信号转导途径。两个品种在软熟期果实质地的差异与细胞壁代谢途径、木质素生物合成途径、植物激素代谢基因和转录因子的调控密切相关。J3R85008159_PG和J3R85010291_XTH的上调表达是促进番石榴软化的重要因素。J3R85010291_TCH4可能通过降低细胞壁的机械强度调控果实软化。木质素合成途径基因(J3R8506005_CAD、J3R8502863_POD、J3R8507303_POD、J3R8500836_LAC和J3R8507803_LAC)的下调表达延缓木质素的积累,促进果实软化。ABA途径调控基因(PYL和SnRK2)、乙烯途径调控基因(ETR/ERS、EBF1/2、EIN3)和相关转录因子家族基因(J3R85017767_MYB、J3R85004770_MYB、J3R85004060_NAC、J3R85006932_NAC、J3R85012461_ERF、J3R85010726_bHLH、J3R85003109_bHLH、J3R85014989_bHLH、J3R85015176_WRKY、J3R85014001_WRKY、J3R85014684_WRKY、J3R85010736_WRKY)可能协同调控细胞壁代谢基因的表达从而影响番石榴软化过程。

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