您好,欢迎访问广西农业科学院 机构知识库!

马铃薯StPGIP基因克隆、生物信息学特征及差异表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 吴玉 1 ; 彭杰椿 1 ; 郑声皓 1 ; 易若兰 1 ; 范斗文 1 ; 黄雅 1 ; 萧燕梅 1 ; 韦荣昌 2 ; 郑虚 2 ; 邓英毅 1 ;

作者机构: 1.广西大学农学院

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词: 马铃薯;StPGIP;基因克隆;生物信息学特征;差异表达;休眠

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2025 年 23 卷 002 期

页码: 362-370

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 以‘桂农薯1号’马铃薯块茎为试材,克隆马铃薯多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因StPGIP的CDS序列,并研究其生物信息学特征和块茎休眠与发芽过程中的特异性表达。结果表明StPGIP基因的CDS全长为1 005 bp,编码335个氨基酸,是位于线粒体或细胞核分泌途径的信号肽蛋白,剪切位点位于第25和26氨基酸之间;其蛋白质二级结构中含有无规卷曲(57.49%)、α-螺旋(24.55%)、β-折叠(2.40%)和延伸链(15.57%),三级结构是由α-螺旋和β-折叠形成的一个保守的马蹄形结构;启动子序列中存在光、水杨酸、脱落酸等响应元件。StPGIP基因与野生无薯系马铃薯(Solanum brevidens Fill)、辣椒(Capsicum annuum L.)、野生潘那利番茄(Solanum pennellii Correll)进化关系较近。RT-qPCR分析表明块茎StPGIP基因表达量在低温贮藏的休眠期内呈下降趋势,萌芽后极显著上升,马铃薯StPGIP基因对马铃薯休眠与发芽有重要影响。研究结果为今后深入挖掘该基因的功能及调控提供了理论依据。

  • 相关文献

[1]干燥和复吸水条件下发菜过氧化物氧还蛋白差异表达与基因克隆. 焦广飞,周有文,游向荣,张亚萍. 2011

[2]cDNA-AFLP和cDNA-SRAP技术在植物基因差异表达上的应用及其分析比较. 李杨瑞,杨柳,王爱勤,杨丽涛,熊发前,甘崇昆. 2009

[3]甘蔗cDNA-SCoT差异显示分析PCR反应体系建立、优化及应用. 李杨瑞,杨丽涛,吴建明. 2013

[4]利用cDNA-SRAP分析赤霉素诱导甘蔗节间伸长的差异表达. 李杨瑞,王爱勤,杨柳,杨丽涛. 2010

[5]赤霉素诱导甘蔗节间伸长的cDNA-AFLP差异显示(英文). 李杨瑞,杨丽涛,方锋学,李强. 2012

[6]单氰氨诱导巨峰葡萄休眠解除过程中重要基因表达的差异. 陈国品,李洪艳,韩佳宇,盘丰平,谢蜀豫,白先进,王博,黄露,仁德. 2014

[7]SCoT标记在甘蔗上的创新利用. 黄杏,丘立杭,陈荣发,李杨瑞,甘崇昆. 2017

[8]外源激素影响苦瓜种子发育过程中蛋白表达的初步分析. 黄如葵,黄熊娟,梁家作,陈小凤,陈振东,冯诚诚,刘杏连,秦健. 2015

[9]菠萝蜜响应低温胁迫的转录组分析. 杜英俊,朱鹏锦,钟云婕,唐秀观,何江,宋奇琦,欧景莉,叶维雁. 2023

[10]低温胁迫对甘蔗叶绿体蛋白质及其相关基因表达的影响. 黄杏,孙富,孙波,杨丽涛,李杨瑞. 2012

[11]石灰氮在巨峰葡萄二季生产中的催芽效应初报. 白先进,李杨瑞. 2005

[12]猕猴桃种子休眠解除影响因素研究. 韩美丽,马跃峰,覃建林. 2014

[13]中国菟丝子种子休眠解除方法研究. 陆荣生,马跃峰,韩美丽,覃建林. 2013

[14]桃树需冷量研究进展. 刘芸,姜新,陆玉英,李一伟,阮经宙,罗瑞鸿. 2019

[15]桃芽休眠机制研究进展. 姜新,刘芸,罗瑞鸿,欧智涛,李一伟,邓立宝,王茜,望飞勇. 2024

[16]木薯AGPase基因的克隆与载体构建. 罗兴录,唐娟娟,许娟,袁胜勇,杨鑫. 2012

[17]红麻6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(6PDGH)基因克隆及RNAi载体构建. 赵艳红,明庭会,余明丽,冉珊敏,钱景华,周瑞阳,陈鹏. 2014

[18]木薯淀粉合成关键酶AGPase小亚基基因全长克隆. 罗兴录,陈会鲜. 2014

[19]产普鲁兰酶克雷伯氏菌的分离鉴定及酶学性质研究. 王青艳,米慧芝,朱绮霞,秦艳,曹薇,朱婧,陆雁,黄日波. 2013

[20]酿酒酵母脂肪酶基因TGL3的克隆及其在毕赤酵母中的高效表达. 卢福芝,曾丽娟,朱绮霞,张搏,韦宇拓,黄日波. 2010

作者其他论文 更多>>