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大豆荫蔽胁迫响应基因GmYUC2的克隆、自然变异分析及KASP分子标记开发

文献类型: 中文期刊

作者: 陈东亮 1 ; 谭玉荣 1 ; 张焦平 2 ; 孙祖东 1 ; 杨守臻 1 ; 唐向民 1 ; 曾维英 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所

2.南京农业大学

关键词: 大豆;GmYUC2基因;耐荫性;自然变异;KASP分子标记

期刊名称: 广西植物

ISSN: 1000-3142

年卷期: 2025 年 45 卷 007 期

页码: 1205-1215

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: YUC2是生长素生物合成中的限速酶之一,参与植物对荫蔽胁迫的响应。该研究以大豆极耐荫品种‘贡豆7号’为材料进行GmYUC2基因克隆,基于394份中国南方大豆自然变异群体的重测序数据及3个环境下的耐荫指数(STI)表型鉴定数据,对大豆荫蔽胁迫响应基因GmYUC2序列进行自然变异分析及开发KASP分子标记。结果表明:(1)从‘贡豆7号’中克隆到GmYUC2基因,其CDS序列长1 148 bp,编码382个氨基酸,编码蛋白均含有FMO-like、Pyr-redox-2和Pyr-redox-3结构域。(2)GmYUC2基因存在4个SNP变异位点,其中3个SNP变异位于内含子中,1个SNP变异位于5_prime_UTR区,SNP2与SNP3之间连锁程度最高(r2=0.988 8),其次为SNP1与SNP4 (r2=0.921 934),SNP1与SNP2之间连锁程度最低(r2=0.475 691)。(3)基于这4个SNP变异位点在394份群体中鉴定出4种单倍型,其中Hap1单倍型与参考基因组Wm82一致,Hap2、Hap3和Hap4均由Hap1经过一步突变而来,Hap2所对应种质的STI极显著小于Hap1,说明携有Hap2单位型大豆种质耐荫性比携有Hap1的强。(4)在荫蔽条件下,极耐荫种质和不耐荫种质中的GmYUC2基因表达量均上调,并且强耐荫种质中该基因的表达量显著高于极不耐荫种质。(5)利用GmYUC2基因的3个SNP变异位点开发的KASP分子标记对18份大豆材料进行验证,基因型和表型的鉴定结果具有88.89%的高度一致性。该研究成功克隆了GmYUC2基因,并发现其在大豆响应荫蔽胁迫过程中具有重要作用,开发出的KASP分子标记可用于大豆资源苗期耐荫性鉴定。该研究为进一步深入解析大豆GmYUC2基因的主要功能和表达调控机制提供了参考,为高效准确地进行大豆耐荫性的分子标记辅助育种提供了理论基础。

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