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龙眼MYB14的生物信息学分析及其基因表达载体构建

文献类型： 中文期刊

作者： 李浩然 1 ; 丁峰 1 ; 张树伟 2 ; 彭宏祥 2 ; 潘介春 3 ; 何新华 3 ; 王颖 3 ; 李琳 3 ; 王金英 3 ; 黄幸 3 ; 谭春露 3 ; 徐炯志 3 ;

作者机构： 1.广西壮族自治区农业科学院/广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

2.广西壮族自治区农业科学院园艺研究所

3.广西大学农学院

关键词： 龙眼;MYB-related;基因克隆;表达载体构建

期刊名称： 福建农业学报

ISSN： 1008-0384

年卷期： 2020 年 35 卷 009 期

页码： 929-936

收录情况： CSCD

摘要： [目的]克隆龙眼MYB-related基因家族中MYB14基因,并对其进行生物信息学分析和基因表达载体的构建,为进一步研究该基因的生物学功能提供基础数据.[方法]通过转录组测序及生物信息学分析得到龙眼MYB14基因全长序列,进一步设计特异引物对其开放阅读框(ORF)全长序列进行克隆和生物信息学分析,同时构建超表达载体.[结果]MYB14基因属于MYB-related家族的TBP-like亚家族,ORF长度831 bp,编码276个氨基酸,有一个MYB结合位点.该蛋白属于非跨膜亲水蛋白,亚细胞定位预测定位于细胞质,存在57个氨基酸磷酸化位点.其二级结构主要由无规则卷曲以及 α-螺旋构成,二级结构与三级结构预测结果高度一致,同源基因进化树分析表明该基因与大麻亲缘关系最近,同时成功构建了植物超表达载体pBI121-MYB14.[结论]本研究克隆得到了龙眼MYB14基因,成功构建表达载体pBI121-MYB14,为该基因功能的研究奠定了坚实的基础.

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