文献类型: 中文期刊
作者: 李战彪 1 ; 莫翠萍 1 ; 陈锦清 1 ; 秦碧霞 1 ; 崔丽贤 1 ; 谢慧婷 1 ; 蒋雅琴 2 ; 汤亚飞 3 ; 蔡健和 1 ;
作者机构: 1.广西壮族自治区农业科学院植物保护研究所/农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室/广西作物病虫害生物学重点实验室
2.广西壮族自治区农业科学院蔬菜研究所
3.广东省农业科学院植物保护研究所/广东省植物保护新技术重点实验室
关键词: 番茄花叶病毒;番茄褪绿病毒;广西;小RNA深度测序;遗传进化分析
期刊名称: 中国农学通报
ISSN: 1000-6850
年卷期: 2023 年 028 期
页码: 92-98
收录情况: CSCD
摘要: 为明确引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病毒病原,采集4个疑似病毒感染的番茄样品,利用小RNA深度测序、RT-PCR、序列分析、遗传进化树的构建等方法对样品进行鉴定及遗传进化分析。研究结果发现,小RNA数据中的41条contigs分别被注释为番茄花叶病毒(tomato mosaic virus,ToMV)和番茄褪绿病毒(tomato chlorosis virus,ToCV);RT-PCR证实了s RNA的结果,且所有样品均存在ToMV和To CV的复合侵染。通过拼接获得ToMV和ToCV RNA2的近全基因序列,ToMV近全基因序列为6383 bp,命名为ToMV-GX;ToCV RNA2的近全基因序列为8031 bp,命名为ToCV-GX。进化树分析发现,本研究获得的ToMV-GX与ToMV中国山西、内蒙古、呼和浩特3个分离物处于一个分支,说明其具有较近的亲缘关系;ToCV-GX与ToCV中国台湾、广东分离物处于一个大分支,说明具有较近的亲缘关系。上述结果证实,引起广西番茄呈现褪绿斑驳和花叶症状的病原是To MV和ToCV,本研究是ToMV和ToCV复合侵染广西番茄的首次报道。
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