文献类型： 中文期刊
作者： 许娟 1 ; 石云平 1 ; 韦绍龙 1 ; 苏祖祥 1 ; 林茜 1 ; 桂杰 1 ; 胡一凤 1 ; 李小泉 1 ;
作者机构： 1.广西农业科学院生物技术研究所;广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室
关键词： 白及;GMP;基因克隆;序列分析
期刊名称： 西南农业学报
ISSN： 1001-4829
年卷期： 2018 年 06 期
页码： 1104-1110
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 【目的】克隆白及GDP-甘露糖焦磷酸化酶(GDP-mannose pyrophosphorylase)基因(Bs GMP)cDNA全长序列,分析该基因生物学信息,为该基因功能的进一步鉴定提供依据。【方法】基于同源序列克隆GMP基因中间片段,并采用RACE技术扩增GMP基因cDNA全长,用DNAMAN、Tmpred及Softberry等软件进行编码多肽序列、理化性质及亚细胞定位等分析。【结果】从白及叶片中克隆到的GMP基因全长1523 bp,其中包含1086 bp的开放阅读框(ORF),编码361个氨基酸,理论蛋白分子量为39.35 k Da,理论等电点为6.03。进一步分析发现该基因具有跨膜结构,亚细胞定位分析发现该基因主要分布于细胞质和线粒体。蛋白三级结构预测显示,Bs GMP蛋白有11个α螺旋,33个β折叠,46个β转角;该蛋白第1~24个氨基酸含有醛酮还原酶的保守结构域,第256~335个氨基酸含有Lbeta H家族保守区。BLAST多重序列分析表明,Bs GMP氨基酸序列与铁皮石斛、蝴蝶兰的亲缘性最高,分别达到95%和92%。【结论】成功克隆到白及GDP-甘露糖焦磷酸化酶基因(Bs GMP),并进行相关生物信息学分析,为该基因的进一步功能研究奠定了基础。
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