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基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

文献类型: 中文期刊

作者: 王宏利 1 ; 赵久成 1 ; 赖淼 1 ; 卢家仕 2 ; 凌启昌 1 ; 肖锦华 3 ; 张华 4 ; 付鑫锋 1 ;

作者机构: 1.广西农业科学院钦州分院

2.广西农业科学院花卉研究所

3.钦州市钦南区那彭镇农业农村服务中心

4.钦州市浦北县北通镇农业农村服务中心

关键词: 黄瓜;SCoT分子标记;亲缘关系;遗传多样性;DNA指纹图谱

期刊名称: 中国瓜菜

ISSN: 1673-2871

年卷期: 2024 年 004 期

页码: 36-45

摘要: 为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT 12和SCoT 83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。

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