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河八王杂交种F1、BC1及其亲本DNA甲基化水平和模式变化

文献类型: 中文期刊

作者: 刘昔辉 1 ; 桂意云 1 ; 张荣华 1 ; 李海碧 1 ; 韦金菊 1 ; 周会 1 ; 杨荣仲 1 ; 张小秋 1 ; 李杨瑞 1 ;

作者机构: 1.广西农业科学院甘蔗研究所/中国农业科学院甘蔗研究中心/广西甘蔗遗传改良重点实验室/农业农村部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室

关键词: 甘蔗;河八王;DNA甲基化;甲基化敏感扩增多态性技术;毛细管电泳技术

期刊名称: 中国农业大学学报

ISSN: 1009-508X

年卷期: 2019 年 24 卷 009 期

页码: 37-46

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为分析河八王及后代基因组DNA甲基化水平和遗传模式变化,以河八王及其后代F1和BC1为材料,采用甲基化敏感扩增多态性技术(Methylation sensitive amplification polymorphism,MSAP)结合毛细管电泳技术(Capillary electrophoresis,CE)分析亲本及后代基因组DNA甲基化水平和遗传模式变化规律.结果 表明:母本‘GT05-3256'的MSAP比率是59.6%,父本‘GXN1’则是60.5%,其杂交种F1的MSAP比率是56.4%~59.0%,均低于双亲;BC1的母本‘YC94-46'的MSAP比率是59.4%,父本‘T6-3’则是59.0%,BC1 MSAP比率是56.9%~69.8%,整体平均为62.8%,平均值高于双亲.BC1世代总甲基化水平略高于F1世代水平.F1和BC1基因组CCGG位点发生甲基化的方式整体上以内部胞嘧啶双链甲基化为主.在F1和BC1中均检测到70种甲基化类型,并进一步分为A、B、C、D和E等5大类,其中A类是亲本向杂交种的甲基化遗传类型;B类是去甲基化类型,表示杂交种相应于其亲本的甲基化减弱;C类是过或超甲基化类型,表示杂交种相应于其亲本的甲基化增强;D类是次甲基化类型,杂交后代甲基化水平比双亲均要低;E类为不定类型.结果 显示,B、C、D、E是杂交种的甲基化变异类型;F1的甲基化遗传类型(A类)比例明显低于BC1,但变异类型B、C、D、E高于BC1;杂交形成F1和BC1过程中,基因组DNA普遍发生了超甲基化修饰.

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