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野生花生Hsp70基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 徐日荣 1 ; 熊发前 2 ; 唐兆秀 1 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院作物研究所

2.广西农业科学院经济作物研究所

关键词： 野生花生;Hsp70基因家族;生物信息学;系统发育;抗高温

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2016 年 38 卷 05 期

页码： 572-581

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 热激蛋白70(heat shock protein 70,Hsp70)是细胞应对高温和其它胁迫环境时所产生的一类分子伴侣类型应激蛋白。本研究以Arachis duranensis和Arachis ipansis基因组数据库为基础,利用生物信息学方法对Hsp70基因家族进行鉴定分析。结果表明,A.duranensis含有34个Hsp70基因成员,A.ipansis含有35个Hsp70基因成员,两者的直系同源基因大部分分布于两套染色体相近的位置。Ad Hsp70和Ai Hsp70基因家族根据亚细胞定位结果可分4种类型,各类型的Hsp70基因结构相对保守。根据系统进化分析Hsp70基因家族可分为ClassⅠ(Hsp70)和ClassⅡ(Hsp110)两个亚家族,其中ClassⅠ亚家族进一步分为3个小家族,同时揭示Hsp70基因家族成员产生于单双子叶分化之前。GO分析预测表明,Ad Hsp70和Ai Hsp70基因家族功能类别完全一致,各功能类别数目比例变化相似。本研究结果有助于了解花生属植物Hsp70基因家族功能,以期为深入研究花生逆境生理过程中的分子调控机理提供基础。

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