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杧果SC-SSR分子标记反应体系的建立与优化

文献类型: 中文期刊

作者: 覃昱茗 1 ; 张宇 1 ; 黄国弟 1 ; 莫永龙 1 ; 罗世杏 1 ; 荣涛 1 ;

作者机构: 1.广西壮族自治区亚热带作物研究所

关键词: 杧果;SC-SSR;正交设计;体系优化

期刊名称: 农业研究与应用

ISSN: 2095-0764

年卷期: 2021 年 003 期

页码: 37-43

摘要: 采用正交设计方法,对影响PCR反应体系的5个因素(Mg2+、Taq DNA聚合酶、dNTPs、引物和模板DNA)进行了优化,建立了适用于杧果的SC-SSR-PCR反应体系。结果表明,总反应体系25μL中,包含模板DNA用量100 ng·mL-1、Mg2+浓度2.00 mmol·L-1、引物浓度0.40μmol·L-1、 Taq DNA聚合酶浓度1.00 U、 dNTPs浓度0.15 mmol·L-1。利用优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系对10对SC-SSR引物进行验证,均能扩增出清晰、明亮、特异的电泳条带。因此,优化的杧果SC-SSR-PCR反应体系适用于杧果种质鉴定和亲缘关系分析。

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