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不同耐寒甘蔗品种的SSR标记分析

文献类型: 中文期刊

作者: 贤武 1 ; 周会 1 ; 梁强 1 ; 桂意云 1 ; 覃丽翻 1 ; 杨荣仲 1 ;

作者机构: 1.中国农业科学院甘蔗研究中心

关键词: 甘蔗;SSR;EST-SSR;耐寒性;聚类分析

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2012 年 33 卷 12 期

页码: 2130-2137

收录情况: CSCD

摘要: 采用197对EST-SSR引物和67对gSSR引物对35个不同耐寒甘蔗品种进行标记,并筛选出36对多态性较好的EST-SSR引物和17对gSSR引物进行遗传多样性分析。结果表明:17对gSSR引物共扩增出87条谱带,平均每对引物扩增出5.1条谱带,PIC值在0.53~0.93,平均值为0.84,引物的DP值在0.54~0.96,平均值为0.87。36对EST-SSR引物共扩增出162条谱带,平均每对引物扩增出4.5条谱带,PIC值在0.43~0.93,平均值为0.79,引物的DP值在0.44~0.96,平均值为0.81。品种间的gSSR遗传相似系数在0.413 8~0.804 6,平均值为0.625 1;品种间的EST-SSR遗传相似系数在0.5145~0.797 1,平均值为0.665 1;因此,本研究中gSSR标记的效果要好于EST-SSR。聚类分析结果表明,35份甘蔗品种可分为7个类群;然而,聚类分析结果并不能反映供试材料的地域特性。耐寒性相对较好的品种分散于5个类群中,说明聚类分析结果并不能把耐寒性好的品种聚成一类;而两三个耐寒性较差的品种能够聚在一起,说明SSR标记对耐寒性较差的品种的聚类起到较好的作用。以上结果为SSR标记在甘蔗耐寒性研究上的应用提供起到一定的参考作用。

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