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甘蔗细胞色素b6-f复合体铁硫亚基(SoCYT)基因的克隆和表达分析

文献类型: 会议论文

第一作者: LIANG Pan-xia

作者: LIANG Pan-xia 1 ; 梁潘霞 2 ;

作者机构: 1.广西农业科学院资源与环境研究所,广西南宁530007

2.中国农业科学院甘蔗研究中心/农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室/广西甘蔗遗传改良重点实验室,广西南宁530007

关键词: 甘蔗;细胞色素b6-f复合体;铁硫亚基基因;基因表达

会议名称: 广西甘蔗学会2016年年会暨学术交流会

主办单位: 广西甘蔗学会

页码: 00001032-00001037

摘要: 以甘蔗叶片总RNA为模板,通过RT-PCR扩增细胞色素b6-f复合体铁硫亚基基因的cDNA,采用生物信息学软件分析所克隆基因的编码蛋白特性,并用荧光定量PCR分析该基因的表达情况.结果表明:克隆得到的cDNA片段长度为796bp,包括1个579bp的开放阅读框,编码192个氨基酸.甘蔗与高粱CYT基因cDNA序列的同源性为94.0%,氨基酸序列同源性为99.0%;该基因推导的蛋白分子量大小为20.67KD,等电点为6.24,疏水性分值在0.50~2.11;蛋白二级结构中α-螺旋占17.19%,随机卷曲占53.12%,延伸链占21.53%,β-转角只占8.33%,GenBAnk登录号为JQ712582.实时荧光定量分析结果表明,随着甘蔗干旱胁迫时间的延长,SoCYT基因表达均呈下降的趋势,PEG与PEG加Si处理的SoCYT基因的表达量有显著差异,加硅可减缓SoCYT基因表达的下降速度和对细胞色素b6/f复合体的结构的损伤和影响.

分类号: S566.1

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