科研产出
香菇单核体交配型及杂交后代的等位基因特异性PCR鉴定
《微生物学通报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：【背景】食用菌交配型和单单杂交杂合子的鉴定通常采用显微镜检测观察是否具有锁状联合的方式进行，存在耗时长、工作量大且易出现误检等问题。【目的】建立一种鉴定香菇单核体交配型和单单杂交后代的分子辅助育种技术，为提高育种效率提供技术支撑。【方法】利用交配型因子保守序列单核苷酸多态性（single-nucleotide polymorphism, SNP）位点设计分型引物，建立等位基因特异性PCR （allele-specific PCR, AS-PCR）技术，鉴定香菇L808和YX7的单孢分离株交配型及其杂交后代。【结果】AS-PCR鉴定结果表明，L808的38个单孢分离株中，交配型为A1B1、A2B2、A1B2和A2B1的单核体分别有6、13、8和11个；YX7的45个单孢分离株中，交配型为A3B3、A4B4、A3B4和A4B3的单核体分别有15、8、8和12个，交配型为A3A4B3B4的异核体2个；12个单单杂交菌株中，10个为真正的杂合子，2个为非杂合子。传统方法与AS-PCR分子鉴定结果完全一致，但前者容易将异核体误判为单核体。【结论】基于SNP位点的AS-PCR技术能有效鉴别香菇单核体交配型和单单杂交后代，区分单核体与异核体，具有精准、高效的特点，是一种香菇分子辅助育种的理想工具。
关键词： 香菇 交配型 杂交后代 单核苷酸多态性 等位基因特异性PCR
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广西番茄晚疫病菌交配型鉴定及生理小种的初步检测(英文)
《广西农业科学 》 2007
摘要：2000-2006年,从广西8个番茄产区采集了508份番茄晚疫病标样,分离纯化获得239个晚疫病菌株。交配型鉴定结果表明,广西番茄晚疫病菌以A1交配型为主,占总菌株数的96.65%;发现8个A2交配型菌株,分布于田阳县、田东县、武鸣县和柳州市。利用6个含有不同单显性抗番茄晚疫病基因的番茄材料T s19、T s33、W.V a700、CLN 2037B、L 3708和LA 1033为鉴别寄主,初步鉴定了来自7个番茄产区32个代表菌株的生理小种,结果共鉴定出5个小种,即T0、T1、T1,2、T1,2,4、T1,2,3,4,5;其中小种T1,2和T1,2,3,4,5是优势小种,分别广泛分布于5个和3个番茄产区,出现频率分别占37.50%、34.37%;其次是小种T0和T1,分别分布于5个和3个番茄产区,出现频率分别占15.63%和9.37%;小种T1,2,4仅在田阳县发现,出现频率为3.13%。这表明广西番茄晚疫病病菌具有复杂的多样性。
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