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资源类型: 中文期刊
关键词:侧翼序列(模糊匹配)
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甘蔗SPSB基因5'侧翼序列的克隆及生物信息学分析

《江苏农业科学 》 2019 北大核心

摘要:蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成途径的关键限速酶,对蔗糖的合成和碳水化合物的分配具有重要的调控作用.采用染色体步移法技术克隆获得了甘蔗SPSB基因5'端侧翼序列,并对其序列进行生物信息学分析.分离获得了4399 bp的5'侧翼序列,该序列除具有启动子核心序列TATA-box和增强子元件CAAT-box等典型的真核生物启动子基本元件外,还含有多种光应答元件、激素响应元件,以及与缺氧、干旱、低温诱导有关的顺式作用元件和一些组织调控表达有关的顺式调控元件,表明ScSPSB启动子可能具有逆境应答、激素应答及组织特异表达特性,值得开展进一步的功能研究.

关键词: 甘蔗 ScSPSB基因 侧翼序列 生物信息学分析

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甘蔗SPSB基因5′侧翼序列的克隆及生物信息学分析

《江苏农业科学 》 2019

摘要:蔗糖磷酸合成酶(SPS)是蔗糖合成途径的关键限速酶,对蔗糖的合成和碳水化合物的分配具有重要的调控作用。采用染色体步移法技术克隆获得了甘蔗SPSB基因5′端侧翼序列,并对其序列进行生物信息学分析。分离获得了4 399 bp的5′侧翼序列,该序列除具有启动子核心序列TATA-box和增强子元件CAAT-box等典型的真核生物启动子基本元件外,还含有多种光应答元件、激素响应元件,以及与缺氧、干旱、低温诱导有关的顺式作用元件和一些组织调控表达有关的顺式调控元件,表明ScSPSB启动子可能具有逆境应答、激素应答及组织特异表达特性,值得开展进一步的功能研究。

关键词: 甘蔗 ScSPSB基因 侧翼序列 生物信息学分析

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富集宏基因组DNA中α淀粉酶全长基因的克隆及重组表达

《中国生物工程杂志 》 2010 北大核心 CSCD

摘要:利用反向-巢式PCR(IN-PCR)从富集土壤宏基因组DNA中克隆到一种α-淀粉酶基因的全序列,其基因登录号为GU045523,测序分析显示与来自Bacillussp.KR-8104耐酸淀粉酶不完整基因同源性为99%。将获得的α-淀粉酶成熟肽基因与表达载体pSE380连接,导入Escherichia coliJM109中,IPTG诱导表达。粗酶液经Ni-NTA、SephacrylS-200纯化后测定酶学性质:重组酶GXAA的最适作用pH为7.0,最适作用温度为75℃,对可溶性淀粉的Km值为11.6g/L。构建突变子E27G、A450T、E27G-A450T,其酶学性质与原始酶没有显著差别。

关键词: 宏基因组 反向-巢式PCR 侧翼序列 α-淀粉酶

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