基于EST-SSR分子标记的澳洲坚果分子指纹图谱构建

黄健婷; 莫怿; 陶亮; 贺熙勇; 何伟; 叶发权; 王文林; 费裕翀; 屈俊辰; 王翊; 李魁鹏; 徐增富; 《基因组学与应用生物学 》 2023 北大核心 CSCD

摘要：本研究利用分子标记技术，分析所收集的澳洲坚果（Macadamia spp.）种质的遗传多样性，构建其指纹图谱，旨在为澳洲坚果遗传资源保护、良种选育和品种鉴定提供技术保障。基于转录组测序结果，开发出了12个特异性强、多态性高的表达序列标签-简单重复序列（expressed sequence tags-simple sequence repeat, EST-SSR）分子标记。对51份澳洲坚果种质进行SSR荧光标记毛细管电泳检测，分析种质的遗传多样性，进行系统聚类及指纹图谱构建。结果表明，12对EST-SSR分子标记引物共检测到72个等位基因，平均每对引物扩增出6个等位基因，多态性信息含量（polymorphic information content, PIC）平均值为0.632,标记多态性高。在遗传相似系数为0.422时，可以将51份澳洲坚果种质分成6类；采用引物代码和多态性片段长度组合法构建了51份澳洲坚果种质的分子指纹图谱。本研究新开发的12个EST-SSR分子标记，可用于澳洲坚果种质资源的亲缘关系分析和品种鉴定。

关键词： 澳洲坚果 转录组 SSR分子标记 分子指纹图谱