文献类型: 中文期刊
作者: 黄健婷 1 ; 莫怿 1 ; 陶亮 2 ; 贺熙勇 2 ; 何伟 3 ; 叶发权 3 ; 王文林 4 ; 费裕翀 1 ; 屈俊辰 1 ; 王翊 1 ; 李魁鹏 1 ; 徐增富 1 ;
作者机构: 1.广西大学林学院
2.云南省热带作物科学研究所
3.广西扶绥坚果日强农业有限公司
4.广西农业科学院
关键词: 澳洲坚果;转录组;SSR分子标记;分子指纹图谱
期刊名称: 基因组学与应用生物学
ISSN: 1674-568X
年卷期: 2023 年 011 期
页码: 1172-1188
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究利用分子标记技术,分析所收集的澳洲坚果(Macadamia spp.)种质的遗传多样性,构建其指纹图谱,旨在为澳洲坚果遗传资源保护、良种选育和品种鉴定提供技术保障。基于转录组测序结果,开发出了12个特异性强、多态性高的表达序列标签-简单重复序列(expressed sequence tags-simple sequence repeat, EST-SSR)分子标记。对51份澳洲坚果种质进行SSR荧光标记毛细管电泳检测,分析种质的遗传多样性,进行系统聚类及指纹图谱构建。结果表明,12对EST-SSR分子标记引物共检测到72个等位基因,平均每对引物扩增出6个等位基因,多态性信息含量(polymorphic information content, PIC)平均值为0.632,标记多态性高。在遗传相似系数为0.422时,可以将51份澳洲坚果种质分成6类;采用引物代码和多态性片段长度组合法构建了51份澳洲坚果种质的分子指纹图谱。本研究新开发的12个EST-SSR分子标记,可用于澳洲坚果种质资源的亲缘关系分析和品种鉴定。
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