利用基因组步行方法克隆柑橘黄龙病病原菌亚洲种序列

李杨瑞; 彭宏祥; 白先进; 杨丽涛; 徐宁; 《园艺学报 》 2009 北大核心 CSCD

摘要：对NCBI基因库黄龙病亚洲种病原菌序列进行拼接,并根据拼接结果在rplKAJL-rpoBC,16S/23S rRNA和omp3个位点上设计引物,采用基因组步行方法,在其亚洲种3个位点上共获得了15168bp非冗余新序列,其中,在rplKAJL-rpoBC位点上5′端上游区和3′端下游区分别获得了3218和2653bp的非冗余新序列;在16S/23S rRNA位点上5′端上游区和3′端下游区分别延伸了1853和2459bp的新序列;在omp基因位点上分别获得了4014和971bp的新序列。序列分析表明在rplKAJL-rpoBC位点上的新序列包含2个新基因(suhB和serA);16S/23S rRNA位点新序列包含4个新基因(膜转运蛋白基因、细胞壁脱氢酶假基因、5S rRNA、tRNAMet),omp位点新序列包含6个新基因(rpsB、tsf、pyrH、frr、cdsA2、cds2)。这些新序列的获得为以PCR为基础的黄龙病相关研究提供了有用的参考依据。

关键词： 柑橘 黄龙病 Candidatus Liberibactor 序列