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利用基因组步行方法克隆柑橘黄龙病病原菌亚洲种序列

文献类型： 中文期刊

作者： 李杨瑞 1 ; 彭宏祥 2 ; 白先进 3 ; 杨丽涛 1 ; 徐宁 2 ;

作者机构： 1.广西大学农学院

2.广西农业科学院园艺研究所

3.广西作物遗传改良生物技术重点开放实验室

关键词： 柑橘;黄龙病;Candidatus Liberibactor;序列

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2009 年 36 卷 04 期

页码： 493-500

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对NCBI基因库黄龙病亚洲种病原菌序列进行拼接,并根据拼接结果在rplKAJL-rpoBC,16S/23S rRNA和omp3个位点上设计引物,采用基因组步行方法,在其亚洲种3个位点上共获得了15168bp非冗余新序列,其中,在rplKAJL-rpoBC位点上5′端上游区和3′端下游区分别获得了3218和2653bp的非冗余新序列;在16S/23S rRNA位点上5′端上游区和3′端下游区分别延伸了1853和2459bp的新序列;在omp基因位点上分别获得了4014和971bp的新序列。序列分析表明在rplKAJL-rpoBC位点上的新序列包含2个新基因(suhB和serA);16S/23S rRNA位点新序列包含4个新基因(膜转运蛋白基因、细胞壁脱氢酶假基因、5S rRNA、tRNAMet),omp位点新序列包含6个新基因(rpsB、tsf、pyrH、frr、cdsA2、cds2)。这些新序列的获得为以PCR为基础的黄龙病相关研究提供了有用的参考依据。

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[1]基于23S/5S rDNA序列的柑橘黄龙病病原菌亚洲种系统发育研究. 白先进,李杨瑞,陈传武,杨丽涛,朱建华,徐宁. 2009

[2]柑橘黄龙病病原菌非洲种和美洲种23S-5S rDNA序列的克隆及分析. 李杨瑞,杨丽涛,徐宁. 2011

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[6]广西近十年柑橘黄龙病综合防控成效与经验（英文）. 邓崇岭,白先进,娄兵海. 2016

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