科研产出
3种方法提取菠萝蜜叶片和种子总RNA的比较
《经济林研究 》 2019 北大核心
摘要：为了筛选最适的菠萝蜜总RNA提取方法,采用Trizol提取法、Tris-硼酸提取法和试剂盒提取法提取菠萝蜜叶片和种子总RNA,通过紫外分光光度计检测、琼脂糖凝胶电泳、RT-PCR检测以及Agilent2100检测,对提取结果进行比较分析。结果表明:采用这3种方法均能从菠萝蜜叶片和种子中提取到总RNA,Tris-硼酸提取法较其他2种方法所提取的总RNA产率高,但杂质较多;采用Tris-硼酸提取法能提取完整性较好的总RNA,28S、18S和5S清晰可见,但提取质量较试剂盒提取法差;试剂盒提取法省时省力,有明显的28S和18S条带,A_(260)/A_(280)分布在1.92～1.98,A_(260)/A_(230)分布在2.04～2.09,叶片总RNA产率42.3 ng/μL,种子总RNA产率15.6 ng/μL。RT-PCR检测结果表明在约200 bp处存在清晰整洁的电泳条带,Agilent 2100检测结果显示杂峰极少,28S峰积分面积约是18S峰积分面积的2倍。经综合评定认为,试剂盒提取法是适合菠萝蜜叶片和种子总RNA提取的方法。
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不同提取方法对检测单头白背飞虱携带SRBSDV灵敏度的影响
《贵州农业科学 》 2019 北大核心
摘要：为找到较好的白背飞虱RNA提取方法用于大规模带毒率检测、SRBSDV的早期监测及科学防控提供参考,采用Trizol试剂盒法、改良Trizol法、改良CTAB-LiCl法、改良异硫氰酸胍法和NaOH粗提法5种方法提取单头白背飞虱的总RNA,进行检测比较其提取速率和稳定性.结果 表明:采用Trizol试剂盒法、改良Trizol法、改良CTAB-LiCl法、改良异硫氰酸胍法和NaOH粗提法5种方法提取单头白背飞虱的总RNA浓度分别为113.08 ng/μL、222.43 ng/μL、57.68 ng/μL、102.16 ng/μL和31.06 ng/μL,改良Trizol法和改良CTAB-LiCl法提取的RNA纯度较高.5种方法提取的RNA均能用于SRBSDV的检测,其中改良Trizol法RT-PCR扩增的灵敏度最高,稀释梯度为10-4,NaOH粗提法灵敏度最差,稀释梯度仅为10-1,其余3种均能达到10-3.改良Trizol法提取的虫体RNA较完整且扩增效果稳定,但试剂价格较昂贵,不适合做大量样品提取;NaOH粗提法的灵敏度虽相对较低,但由于操作简便,经济快速,更适合用于大量样品的检测.
关键词： 白背飞虱 总RNA 南方水稻黑条矮缩病毒 RT-PCR灵敏度
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凤梨释迦总RNA提取方法探究及质量分析
《分子植物育种 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：以凤梨释迦叶片、茎尖、根尖、花、幼果和成熟果为材料,分别采用改良热硼酸盐法、异硫氰酸胍法、Trizol法、RNA试剂盒法和改良RNA试剂盒法5种RNA提取方法提取总RNA,并从操作时间、成本、纯度与浓度等方面比较分析各种方法的提取效果,以期筛选最适合凤梨释迦各组织的RNA提取方法。结果表明:5种RNA提取方法提取的RNA差异较大,其中改良RNA试剂盒提取法最适合凤梨释迦各组织总RNA的提取,且RNA的质量最好。研究结果为提取高质量的凤梨释迦以及番荔枝科植物的总RNA提供参考。
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不同方法提取木薯茎总RNA效果的比较研究
《北方园艺 》 2013 北大核心
摘要：以木薯为试材,采用异硫氰酸胍法、热硼酸盐法、Trizol法、TransZol Plant试剂盒法4种不同方法分别提取木薯茎中总RNA,并对其提取效果进行了比较分析,探讨木薯总RNA的有效提取方法。结果表明:除了热硼酸盐法不能有效地提取木薯茎中总RNA以外,其余3种方法均能有效地提取木薯茎中总RNA。其中异硫氰酸胍法提取效果最好,不仅提取耗时最短,仅为1.5h,而且提取的总RNA质量和纯度相对最好。该方法是一种适合于木薯茎中总RNA提取的简单高效的方法。
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