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3种方法提取菠萝蜜叶片和种子总RNA的比较

文献类型： 中文期刊

作者： 张宇 1 ; 黄国弟 1 ; 莫永龙 1 ; 欧克纬 1 ; 艾静汶 1 ; 何江 1 ;

作者机构： 1.广西农业科学院 亚热带作物研究所

关键词： 菠萝蜜;叶片;种子;总RNA

期刊名称： 经济林研究

ISSN： 1003-8981

年卷期： 2019 年 37 卷 02 期

页码： 89-94

收录情况： 北大核心

摘要： 为了筛选最适的菠萝蜜总RNA提取方法,采用Trizol提取法、Tris-硼酸提取法和试剂盒提取法提取菠萝蜜叶片和种子总RNA,通过紫外分光光度计检测、琼脂糖凝胶电泳、RT-PCR检测以及Agilent2100检测,对提取结果进行比较分析。结果表明:采用这3种方法均能从菠萝蜜叶片和种子中提取到总RNA,Tris-硼酸提取法较其他2种方法所提取的总RNA产率高,但杂质较多;采用Tris-硼酸提取法能提取完整性较好的总RNA,28S、18S和5S清晰可见,但提取质量较试剂盒提取法差;试剂盒提取法省时省力,有明显的28S和18S条带,A_(260)/A_(280)分布在1.92～1.98,A_(260)/A_(230)分布在2.04～2.09,叶片总RNA产率42.3 ng/μL,种子总RNA产率15.6 ng/μL。RT-PCR检测结果表明在约200 bp处存在清晰整洁的电泳条带,Agilent 2100检测结果显示杂峰极少,28S峰积分面积约是18S峰积分面积的2倍。经综合评定认为,试剂盒提取法是适合菠萝蜜叶片和种子总RNA提取的方法。

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