科研产出
基于BSA重测序的辣椒CMS恢复基因连锁分子标记开发
《热带作物学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：三系配套是辣椒育种的主要研究方向,鉴定并开发辣椒恢复基因连锁标记是利用分子标记辅助选育恢复系的难点.本研究以自主选育的辣椒胞质雄性不育系 014A 和恢复系 014C 为亲本构建 F2 分离群体,经 χ2 测验可育与不育的分离比例符合 3∶1,表明辣椒胞质雄性不育育性恢复性状受 1 对显性基因控制.采用 BSA 法构建可育和不育极端DNA混池,全基因组重测序并与参考基因组比对,通过SNP-index法和Fisher检验将辣椒胞质雄性不育恢复基因定位于辣椒第 6 号染色体顶端 1.44~8.28 Mb的区域内.根据亲本间SNP/InDel差异设计引物,在亲本和极端池筛选多态性引物,得到能稳定扩增出特异条带的分子标记PP5 和OP59.这 2 个标记在极端群体验证中准确率均达到 100%;标记OP59 是共显性标记,位于恢复基因的候选基因T459-15819间区 17232 bp,该标记在不育群体准确率为 100%,在可育群体准确率为 97.21%;标记PP5 位于恢复基因的候选基因T459-15819下游 318 bp,该标记在不育群体和纯合可育群体准确率均为 100%,不能区分杂合可育类型.该研究获得与恢复基因紧密连锁 2 个标记为加速选育辣椒CMS恢复系奠定基础.
关键词： 辣椒 全基因组重测序 胞质雄性不育 恢复基因 分子标记
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基于广西普通野生稻染色体单片段代换系的Rf3和Rf4复等位基因的恢复效应分析
《分子植物育种 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：本研究以5份广西普通野生稻材料DP15、DP29、DP30、DP50和DP63为供体亲本,以栽培稻品种9311为受体亲本,通过杂交及多代回交获得携带Rf3或Rf4基因座位的染色体单片段代换系8个。进一步将分别携带Rf3和Rf4基因座位的单片段代换系两两杂交、自交,筛选出同时具有这2个基因座位的双片段聚合系2个。通过野败型细胞质不育系(WA-CMS)盟抗A对单片段代换系和双片段聚合系进行恢复力测定。研究结果显示:(1)8个单片段代换系对盟抗A的恢复能力有显著不同:来自DP15的Rf3基因与来自DP15、DP30、DP50和DP63的Rf4基因具有强恢复力,它们的F1植株花粉育性达到86.18%~91.13%;来自DP29的Rf4基因具有较强的恢复力,其F1植株花粉育性为81.21%;来自DP29的Rf3基因具有弱恢复力,其F1植株花粉育性为7.00%;而来自DP30的Rf3基因没有恢复能力,其F1植株花粉育性仅为0.33%。(2)Rf3或Rf4基因的聚合效应在不同供体间表现不同:来自DP29的较强恢复基因(Rf429)与弱恢复基因(Rf329)间聚合呈现显著的累加效应;而来自DP15的2个强恢复基因(Rf315和Rf415)聚合后没有进一步提高恢复能力。研究结果表明,利用广西普通野生稻挖掘育性恢复基因是有效的,获得了多个对野败型细胞质不育系(CMS-WA)盟抗A具有强恢复力的Rf3或Rf4位点复等位基因,可供育种研究利用。
关键词： 普通野生稻 野败型 染色体单片段代换系 聚合系 恢复基因
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广谱强恢复系GR38对籼粳两类型不育系的恢复基因分析
《西南农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：GR38是自育的偏粳型广亲和性广谱强恢复系种质,为了解其对籼、粳两种类型不育系的恢复特性,发掘该恢复系的育性恢复基因,利用GR38分别与籼型不育系G46A和粳型不育系光A杂交的F2群体,应用集团分离分析方法和SSR标记对GR38的育性恢复基因进行鉴定和定位。结果在G46A/GR38的F2群体中检测到两个独立的育性恢复基因,分别位于第1染色体短臂上的SSR标记RM1331与RM3740之间以及第1染色体长臂上的SSR标记RM5310与RM486之间;在光A/GR38的F2群体中只检测到一个育性恢复基因,位于第1染色体短臂上的SSR标记RM3740与RM490之间。GR38对籼粳两种类型不育系的恢复基因既有共同亦有差别,对籼型不育系G46A的恢复性由两个基因控制,而对粳型不育系光A的恢复性只由一个基因控制,恢复基因均来自第一染色体,其中,位于第1染色体短臂上的恢复基因在籼粳背景下均起恢复作用,根据其在染色体上的位置,推测与Rf3等位。
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广西普通野生稻Rf3和Rf4恢复基因位点的遗传多样性
《杂交水稻 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用与Rf3和Rf4紧密连锁的SSR标记RM10353和RM6100对106份广西普通野生稻核心种质材料的细胞质雄性不育恢复基因的等位性进行了分析。结果显示:在广西普通野生稻中,Rf3和Rf4座位各检测到6种类型的等位基因,等位基因频率分别在0.033 0～0.584 9和0.028 3～0.462 3之间,有效等位基因分别为2.488 6和3.444 5,Shanon’s信息指数分别为1.221 4和1.453 2。表明在广西普通野生稻中,Rf3和Rf4座位的遗传多样性很高。
关键词： 普通野生稻 恢复基因 Rf3 Rf4 等位基因 遗传多样性
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